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水稻Wx―YMZC标记的开发与利用.doc
水稻Wx―YMZC标记的开发与利用
摘要:设计了一个新分子标记Wx-YMZC,改良检测Wx基因中(CT)n和G/T类型的方法,使用该标记只需要1次PCR扩增和1次酶切即可检测,简化了试验。此方法已获专利授权(专利号:ZL2013 1 0488947.7)。通过对55份水稻资源进行Wx基因型检测,分析和验证了不同Wx基因类型对直链淀粉含量的影响,即:①高AC(22.0%)的资源具有较小n值(n≤14)的(CT)n重复次数的等位基因,在除糯米外的其他水稻资源中,具有低或中等AC的资源都具有较大n值(n≥16)的(CT)n重复次数的等位基因;②Wx基因中G型资源的AC高于T型资源;③Wx基因中存在着(AATT)n的重复序列,其中(AATT)6重复序列的资源多属于高AC,(AATT)5重复序列的资源多属于低或中等AC。还利用Wx-YMZC分子标记对13份R7606系列品系进行了应用研究。
关键词:水稻资源;Wx基因;直链淀粉含量;分子标记;R7606
中图分类号:S511 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2015)24-6134-05
DOI:10.14088/ki.issn0439-8114.2015.24.007
Abstract: Designed a new molecular marker associated with Wx gene,which had been authorized patents(ZL2013 1 0488947.7),meanwhile used this marker to detect 55 rice resources. Compared with the conventional method to detect the (CT)n and G/T type of the Wx gene, the new marker only use one PCR amplification and enzyme digestion,meanwhile, there were further analyses and validations of different Wx gene types on the influence of amylose content:1) Resources of high AC had allleles with smaller numbers of (CT) repeats, (i.e.,n≤14), and conversely all resources of low to intermediate AC,except glutinous rice resources, had allleles with larger numbers of (CT) repeats,(i.e.,n≥16);2) The amylose content with G type resources in Wx gene was higher than T ones; 3) Majorty of the resources with high AC had the (AATT)6 allele in the Wx gene,whereas most of the resources with low AC had the (AATT)5 allele.We analysed the (CT)n and G/T type of the Wx gene of 13 R7606 varieties.
Key words:rice resources;Wx gene; amylose content;molecular maker;R7606
随着生活水平的不断提高,越来越多的消费者选择优质稻米。直链淀粉含量(AC)是影响稻米品质最重要的因素。直链淀粉主要由Wx基因编码的颗粒性结合淀粉合成酶(GBSS)催化合成[1],不同Wx基因类型的资源其AC存在差异。稻米的AC主要受Wx基因控制[2]。Bligh等[3]发现在Wx基因前导序列的第一内含子5′端剪切位点的上游55 bp处存在一段(CT)n的重复序列,针对该重复序列设计了一对标记“484/485”,一些学者对Wx座位进行了复等位基因的分析,发现(CT)n存在多态性,这些多态性与水稻直链淀粉含量之间存在显著的相关性[4-6]。但在后续的研究中发现标记“484/485”存在PCR扩增效果和重复性较差等问题。蔡秀玲等[7]设计一个CAPS标记PCR-AccⅠ,该标记在第一内含子5′端和第一外显子连接处的上下游设计了一对相距420 bp的引物,且这一区域中没有另外的AccⅠ的识别位点,P
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