基于文献的生物医学知识发现方法与工具资料51p.ppt

* * * * * * * * * * * * 闭合式知识发现过程是从A和C出发，寻找共同的中间词B。其目的是验证开放式研究发现的一些关系是否有实际的生物学意义。Swanson开发的网络应用软件ARROWSMITH即体现了闭合式挖掘这一思想。在成功预言了镁缺乏与神经系统疾病（1988年）的关系之后，Swanson又利用ARROWSMITH系统成功地预言了消炎痛与阿尔茨海默氏症（1996年）、雌激素与阿尔茨海默氏症（1996年）、游离钙磷脂酶A2与精神分裂症（1998年）之间的关系，并发现了可以作为生物武器的潜在病毒（2001年）。 * * * * * * * * 2001年,Swanson 等利用ARROWSMITH发现了还有很多病毒可作为潜在的生物学武器 * * * * 开放式知识发现的过程是，对某个初始研究主题A，在MEDLINE的标题字段检索其相关文献，寻找与A在标题中共同出现的中间词B，通过筛选得到有一定意义的B，进而重复上述过程，得到目标词C。 开放式挖掘初衷是从某个疾病或药物初始，寻找疾病的潜在病因和治疗方法或者药物的潜在治疗应用。 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 标题 – 链接到文章摘要或整篇文章（如果文章可在网上找到） 引用者 – 提供引用该组文章的其他论文。 相关文章 – 查找与本组文章类似的其他论文。 图书馆链接（在线） – 通过您已建立联属关系的图书馆资源找到该项成果的电子版本。在您登录校园网后将自动显示这些链接。 图书馆链接（离线） – 找到藏有这项学术成果的图书馆。 同组文章 – 查找您可能看到的同属这组学术研究成果的其他文章，可能是初始版本，其中有预印本、摘要、会议论文或其他改写本。 网络搜索 –? Google 搜索中关于该研究成果的信息。 Scirus 综合性最强的web科研工具。4.5亿条记录，不仅仅有期刊上的内容，还有科学家的主页、课件、预印文本、专利和科研单位的收藏和网站信息。 由Elsevier科学出版社开发。 Scirus 覆盖的学科范围包括：农业与生物学，天文学，生物科学，化学与化工，计算机科学，地球与行星科学，经济、金融与管理科学，工程、能源与技术，环境科学，语言学，法学，生命科学，材料科学，数学，医学，神经系统科学，药理学，物理学，心理学，社会与行为科学，社会学等。 每月更新，可检索1973-2002年间发表的文献。 生物医学信息检索技巧 学术搜索引擎 Google scholar的使用 Scius的使用 Medical Matrix 网络资源利用工具 Faculty of 1000 Medicine RRS的使用 Medical Matrix 由美国医学信息学会主办，其收集的内容专业、全面，是目前最重要的医学专业搜索引擎。 只需在首次访问时注册，即可免费使用，提供了关键词搜索和分类目录，非常适合适合临床医师使用。 分类目录是其主要特色，按各种医学信息分为专业（Specialties）、疾病种类（Diseases）、临床应用（Clinical Practice）、文献（literature）、教育（Education）、健康和职业（Healthcare and Professionals）、医学和计算机（Medical Computing，Internet and Technology）、市场（Marketplace）等8大类。 Medical Matrix 每一大类下再根据内容的性质分为新闻（News）、全文和多媒体（Full Text/MultiMedia）、摘要（Abstracts）、参考书（Textbooks）、主要网址（Major Sites/Home Pages）、操作手册（Procedures）、实用指南（Practice Guidelines/FAQS）、病例（Cases）、临床和和病理图像（Images、Path/Clinical）、患者教育（Patient Education）、教学资料（Educational Materials）等亚类。 对链接的网址按一到五个星进行分级，并且附有简明扼要的评论，便于使用者事先决定是否进入其网页进一步阅读，以节省时间。另外还提供免费的mailing list,定期发布网上医学资源变化情况的通知。 Faculty of 1000 是一种新型的文献发现和研究工具，由BioMed Central所出版。 由2400多位专家学者推荐，提供目前世界上最重要的生物学论文资讯及研究趋势。提供超过1000名顶尖科学家的一致推荐。 有系统地组织并评价大量的科学论文信息，收录每