DNA条形编码在昆虫学中的应用摘要.docVIP

DNA条形编码技术在昆虫学中的应用 摘要：本文DNA条形的产生发展在昆虫学基础研究与实践应用。 ：DNA条形码；学； Abstract:DNA barcoding is a new technology in the field of biological taxonomy. Its essence is a piece of DNA fragment containing biological information. It is a quick and accurate way to identify species by using the gene fragment. This article mainly aims at the production and development of DNA barcoding. Some aspects of insect taxonomy of basic research and practical application will be summarized as well. Key words:DNA barcoding;entomology;application 前 言 所有生物学研究的基础鉴定。昆虫作为世界上物种数量最多的类群，其在分类上存在大量争议，虽已有达170多万个物种已被命名[1]，尚有大量种类有待我们去发现、描述和命名，因此其分类任务复杂而艰巨。近几年，随着分子生物学技术的飞速发展，DNA条形编码技术的应运而生，具有简便、准确快速、易操作等优点[2]。这不仅弥补了传统形态分类的诸多不足，为提高昆虫物种鉴定效率、辅助发现和描述新种和隐种、系统发育研究、入侵物种检测与鉴定、法医昆虫上的应用以及保护昆虫物种资源多样性等提供了新的研究方法。本文综述了DNA条形编码技术的产生、发展以及其在昆虫学基础研究与实践应用等方面，旨在使人们对这项新技术有一个更加深入的了解。 DNA条形编码技术，类似于商品条形码，在分类学研究领域人们采用生物体的某段DNA序列作为标记，以此来标识一个物种。这项技术即为DNA条形码（DNA barcoding）[3]。 21世纪初，德国进化生物学家Tautz教授首次提出，将DNA作为生物分类研究平台的观点[4]-[5]。随后，加拿大Hebert教授[6]提出了DNA barcoding的概念，即通过对线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因（mtDNA COⅠ）5’端一段长度约为650bp的基因片段进行测序和序列分析，进而在DNA水平上成功区分物种。他还提出线粒体COⅠ基因的序列可以作为物种的条形码，为全球所有生物进行编码，且认为利用COⅠ基因从分子演化的角度，将提供一种快速、方便且可信的分类方法。 DNA barcoding本质就是一段DNA片段，这个片段具有的某些特点可以使其成为某一物种的分子标签，即人们以已知的一系列分类单元的DNA序列为参考，通过序列间相似度的评价来实现物种的鉴定[3]。COⅠ基因之所以能作为鉴定的依据，是因为昆虫线粒体DNA是共价闭合的环状双链DNA分子，没有重组、倒位、易位等突变现象，组成相当稳定，严格遵循母系遗传[7]。而COⅠ基因是线粒体蛋白编码基因之一，密码子第三位碱基不受自然选择压力的影响，可以自由变异，且COⅠ的演化速率是其他蛋白编码基因的3倍，有足够的变异能够将物种区别开来，COⅠ还具有较少的插入和缺少，两端序列有相对的保守性的特点，是较好的分子标记，被众多学者在研究中使用。 DNA barcoding的技术流程主要包括样品获取、DNA提取、PCR扩增、序列测定、序列比对及根据序列差异进行判别[3]。 3 DNA条形编码技术在昆虫分类中的应用 DNA片段作为不同分类水平的研究材料是很重要的基因和碱基位点进化快的基因和碱基位点适于亲缘关系较近类群的系统学研究，进化慢的则适于远源类群的系统学研究。下图为线粒体DNA基因序列各区域的应用范围[8]-[9]。 表1 线粒体DNA序列各区域应用范围 ＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊＊DNA条形码最初的目标就是对动物进行物种的鉴定与分类，其理论基础是每一个物种都具有独一无二的条形码序列，并且种间差异不小于种内差异的10倍，因此条形码可以从分子水平上快速地、直接地为基于形态的分类系统提供信息[2]。至今，DNA条形码在昆虫很多类群中都表现出了很好的物种鉴定和分类的能力，比如在昆虫鉴定方面：我国的范京安等[10]选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料，探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性，得到了果实蝇属6个物种的COⅠ序列，准确性与DNA条形码基本一致，它们均可作为果实蝇物种鉴定的有效依据。潘程莹等[11]以我国常见的斑腿蝗