第三章病毒的分类和命名.doc

第三章 病毒的分类和命名 一、 概述 二、 病毒分类和命名的规则 三、 动物病毒分类和命名的现状 一、概 述 根据国际病毒分类委员会(ICTV)1995年的第六次报告，现在已知的病毒有3600多种，它们分别属于71个病毒科中，其中动物病毒(包括脊椎动物病毒和无脊椎动物病毒)有2000余种，分属27个病毒科，而且可以肯定还有许多未被发现的新的动物病毒存在，或者还有新的病毒即将产生。 按照某些共同的特性，将已知的病毒进行适当的分类，在理论上和实践上均具有重要意义。病毒分类不仅有利于对已知病毒的认识和研究，促进对未知新病毒的发现，而且有助于对病毒的利用以及对病毒病的控制。例如我们可以根据同科或同属病毒之间共同抗原的存在，利用同科异属或同属异种的病毒进行免疫预防。 应用牛痘苗预防人的天花就是一例，虽在当时仅仅是一种偶然发现。应用鸽痘病毒预防鸡痘，应用火鸡疱疹病毒预防鸡的马立克氏病(也是一种疱疹病毒性疾病)，也都是这方面的明显例子。 一个理想的动物病毒分类方案，既要反映病毒之间的内在联系，又能被广大病毒工作者所接受，也就是说，应在着重依据病毒本身特性的同时，相应考虑使用时的方便，要有利于人们了解和研究病毒的本质，有利于人们利用和开发病毒以及开展病毒性疾病的预防、诊断和治疗。这也是1966年7月在莫斯科召开的第九届国际微生物学会议上专门成立国际病毒命名委员会(简称ICNV，1973年后改称国际病毒分类委员会，简称ICTV)的原因，ICTV的任务是建立适合所有病毒通用的分类系统，以便统一协调病毒的分类和命名。病毒的分类和命名是全世界病毒学工作者共同的责任，不论何人在何时、何地都可以将自己的有关建议提交给ICTV相应的分委员会(ICTV设执行委员会以及细菌病毒、真菌病毒、无脊椎动物病毒、植物病毒、脊椎动物病毒、病毒数据和协调分委员会等七个分委员会)讨论。ICTV对每一项建议都采取十分慎重的态度，凡经ICTV执委会通过的新建议，需在三年一度的ICTV全体会议上表决批准。某些ICTV批准的建议不经预先出版便得到通过，这样的建议随后将首先发表在ICTV的报告上；其它建议首先在国际微生物学联合会(IUMS)病毒分会的官方杂志——《病毒学文献》(Archives of Virology)上发表，以使更多的病毒学家们详细阅读并阐述自己的观点。 二、病毒分类和命名的规则 1. 病毒的分类规则 早在1950年第五届国际微生物学会议上就提出了初步的病毒分类规则，此后经过多次增补和修订。总的说来，ICTV的分类规则以病毒的基本特性为依据，这些特性概括起来包括以下几个方面。 (1) 病毒的形态学：病毒粒子的大小和形状，呈球形、子弹状、砖形、卵形或杆状、丝状还是多形态；有无表面纤突及纤突的特征；有无囊膜；衣壳对称型和结构、立体对称、螺旋对称、还是复合对称；立体对称病毒粒子的壳粒数目或螺旋对称病毒的核衣壳直径。 (2) 理化学特性：病毒粒子的分子量、浮密度、沉降系数，对酸碱(pH)的稳定性，对热的稳定性，对两价离子的稳定性，对脂溶剂(乙醚或氯仿)的稳定性，对去污剂的稳定性，对幅射的稳定性。 (3) 基因组：核酸类型(DNA或RNA)；基因组大小(kb)；是单股还是双股、线状还是环状；正义、负义或双义；是整个的还是分节段的，节段的大小和数目；核酸的序列或部分序列，是否具有重复序列，是否有同聚物，G+C含量；5端帽的存在与否和类型，5端共价结合蛋白存在与否，3端多聚A尾的存在与否。 (4) 基因组结构和复制策略，开放阅读框架的数目和位置，转录特征，翻译特征，翻译后加工特征。 (5) 蛋白质：结构蛋白的数目、大小和功能活性，非结构蛋白的数目、大小和功能活性；蛋白质的特殊功能活性，尤其是转录酶、反转录酶、血凝素、神经氨酸酶和融合特性；氨基酸序列或部分序列，糖基化、磷酸化、豆寇酸化的程度；表位图谱。 (6) 脂质含量和特性 (7) 糖类含量和特性。 (8) 在细胞培养中的生长特性：包括对细胞种类的特异性，病毒蛋白的聚集场所，病毒粒子的装配场所，病毒粒子成熟和释放的部位和性质。 (9) 抗原性：与其它相关病毒的血清学关系。 (10)生物学特性：包括自然宿主范围，传播方式，传播载体，地理分布，致病性及与疾病的关系；组织嗜性，病理学和组织病理学。 2.病毒的命名规则 自1966年制订病毒命名规则以来，已作了多次修正。 首先，在1970年墨西哥会议上进行了修正，18条规则发表于ICNV第一次报告上； 1975年马德里会议上对其中5条进行了修改，删除2条，全部规则见于ICTV第二次报告中，此时共有16条；第二次报告虽然已有了统一的命名规则，但对于“种”命名的三条规则太概括化，无法指导病毒学家进行病毒种的描述和命名。 鉴于此，1980年4