PhoB的基因克隆及生物信息学分析.pdfVIP

第 34 卷 第 6 期 广东海洋大学学报 Vol . 34 No.6 2014 年 12 月 Journal of Guangdong Ocean University Dec. 2014 溶藻弧菌双组分调控系统 PhoR/PhoB 的基因克隆及 生物信息学分析 张燕飞 1, 2, 3，庞欢瑛 1, 2, 3，吴灶和 2, 3, 4，简纪常 1, 2, 3，鲁义善 1, 2, 3 （1. 广东海洋大学 水产学院 // 2. 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室 // 3. 广东省水产经济动物病害控制重点实验 室，广东 湛江 524088；4. 仲恺农业工程学院，广东 广州 510225） 摘 要：双组分调控系统（Two-component Regulatory System）在致病菌的生长及毒力调控中起重要作用。克隆溶 藻弧菌（Vibrio alginolyticus）HY9901 株组氨酸激酶 PhoR 和反应调控因子 PhoB 的全长基因，并对其进行生物信 息学分析。序列分析结果显示，phoR（GenBank 登录号：KJ958404）全长 1 299 bp，共编码 432 个氨基酸；phoB （GenBank 登录号：KJ863646）全长 690 bp，编码 229 个氨基酸。构建 PhoR/PhoB 的系统进化树，结果显示，溶 藻弧菌 PhoR/PhoB 与副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus）、哈氏弧菌（Vibrio harveyi）有较近亲缘关系。利用 SWISS-MODEL 软件，对PhoR/PhoB 中两个相对保守的功能域 HATPase_c 和 REC 进行同源建模，发现HATPase_c 具有 1 个 ATP 结合位点，REC 具有 4 个天冬氨酸活性位点。 关键词：溶藻弧菌；双组分调控系统；PhoR/PhoB；基因克隆；生物信息学 中图分类号：Q78；Q939.129.3 文献标志码：A 文章编号：1673-9159（2014）06-0022-09 Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of Two-component Regulation System PhoR/PhoB from Vibrio alginolyticus HY9901 1,2,3 1,2,3 2,3,4 1,2,3 1,2,3 ZHANG Yan-fei , PANG Huan-ying , WU Zao-he , JIAN Ji-chang , LU Yi-shan （1. Fisheries College, Guangdong Ocean University // 2. Guangdong Provincial key Laboratory of Pathogenic Biology and Epidemiology for Aquatic Economic Animals // 3. Key Laboratory of Control for Disease of Aquatic Animals of Guangdong Higher Education Institutes, Zhanjiang 524088, China; 4. Zhongkai university of Agriculture and Engineering, Guangzhou 510225, China） Abs