转录因子与DNA相互作用的研究方法.pdfVIP

MedMd 医学分子生物学杂志，2006．3(1)：77—9J BtoI，2006．3(”：77々9 转录因子与DNA相互作用的研究方法 刘玉，柳， 军事医学科学院基础医学研究所北京市，100850 【摘要】 转录因子与DNA的相互作用是基因表达调控系统的重要组成部分。研究二者相互作用的特点． 有助于阐明基因表达调控的规律。二者的相互作用取决于二者所特有的结构，以及在此基础上所产生的各 种相互作用力。研究DNA-蛋白质复合物的方法主要分为2类：实验方法和生物信息学方法。目前已经有多 种实验方法用于研究转录因子与DNA的相互作用，包括指数富集的配基系统进化技术、噬菌体展示技术及 DNA做阵列技术等；以计算机为辅助的生物信息学方法也越来越广泛地用于二者相互作用的研究。 【关键词】 转录因子；DNA：研究方法 【中圈分类号J R爿9．“ Research forthe of Factors-DNAIn． Techniq眦sStudy Tra吣cription teractions LIUYu．LIUChua“ |mthute可B∞记Meatcnl Medi∞I sc沁n明s，Acade埘_《Mn醯甜ySc记麟．Be珏iRg，I00850，Chtnn The interactlonbetween factorsandtheirDNA sitesareim． 【Abstract】 transcription recognition for 0f that the tllenetworkcontml5 is tounderstandthe port8nt r。gulation geneexpression，Ithelpful of interactions，Theinteractionsare regulatorypathwaysgeneexpressionbyelucidatiog DNA—pmtein contmlledtheir At there of by st九Ictures． aretwokjndsmelhods吖ailableforthe specjal present 0f theil methodsand 咖dy interactioⅡs，incIudingexpeljmental bloinforrnaticone量Thereareseveml metllodssuchassvstemicevoluti011of h、r expe“mental 1igandsexponentiaIenrichment(SELEX)． Biolnformatic the interac— phagedi8play(PD)，DNAmicroaⅡays，etc．． techniquesf0。predicti“g tion8haveledtoconsiderableinrecent reviews血emethodscurrentlvbe． progress years．Thispaper inthesmdvof interactions． ing