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大规模GO注释的生物信息学流程_黄子夏.pdf
第 卷 第 期 ( )
51 1 厦门大学学报 自然科学版 Vol.51 No.1
年 月 ( )
2012 1 Jan.2012
JournalofXiamenUniversit NaturalScience
y
大规模GO注释的生物信息学流程
*
, ,
黄子夏 柯才焕 陈 军
( , )
厦门大学海洋与环境学院 福建厦门 361005
摘要: ,
随着新一代测序技术的不断发展 海量的序列数据将为生物学研究者挖掘基因信息提供巨大的资源 信息挖掘
.
, ( , )
的一项重要工作是对序列进行功能注释 其中最重要的功能注释方式是基因本体论 的注释 利用生
GeneOntolo GO .
gy
物信息学方法和软件工具集成了针对 序列的大规模 注释流程( , ) 该
EST GO larescaleGO annotation ieline LSGAP .
-
g pp
流程集合了 、 以及 等软件和 、 或 等常用蛋白数据库 用户可以将 序列
BLAST B2 4 ie We o Swiss rotNr Interro . EST
g pp g p p
,
通过此流程最终获得可视化的 分类统计图表 直观地显示基因在不同过程中的参与情况 为了验证 的准确
GO . LSGAP
, ( )
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