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DNA甲基-化对核小体结构的影响
DNA甲基化对核小体结构的影响;DNA Methylation Increases Nucleosome Compaction and Rigidity
John S. Choy,Sijie Wei,Ju Yeon Lee,Song Tan,Steven Chu,and Tae-Hee Lee*
Department of Chemistry, The Pennsylvania State University, University Park, Pennsylvania 16802, United States
J. AM. CHEM. SOC.VOL. 132, NO. 6, 2010
Effects of DNA Methylation on the Structure of Nucleosomes
Ju Yeon Lee and Tae-Hee Lee*
Department of Physics, Bio-X Program, Stanford UniVersity, Stanford, California 94305, and Department of
Chemistry and Department of Biochemistry Molecular Biology, The PennsylVania State UniVersity,
UniVersity Park, PennsylVania 16802
J. Am. Chem.Soc. 2012, 134, 173?175
;核小体:;DNA甲基化有什么用?;CpG甲基化----核小体的结构
了解基因表达
新药开发治疗CpG甲基化有关的疾病
ATTENTION:
癌症共同特征之一:
启动子区甲基化-抑癌基因失活
;启动子附近的甲基化CpG岛可防止??录酶结合
转录抑制因子结合甲基化的CpG岛,即通过蛋白的作用致使染色质交联从而阻止转录
另外由于DNA和组蛋白结合在一起,还可能是甲基化改变了核小体的结构;anyway,并不否认前两种假设存在;单分子检测更加直观,全面,精确
(fuorescence resonance energy transfer,FRET)
;SM FRET measurements;荧光共振能量转移效率理论公式;测得不同的FRET效率
↓
代表不同的DNA实际两端距离
↓
表示DNA不同的缠绕方式
↓
不同的核小体结构;单分子的构建;天然凝胶电泳
cy3,cy5 channel
两种核小体带
;FRET检测结果;FRET 0.4;DNA甲基化如何影响核小体结构?;偏振度
;进一步的,该课题组做了更深入的研究发现
CpG基甲基化
DNA紧密包裹组蛋白核心拓扑结构的变化。;两种不同的核小体构建;两种核小体甲基化前后的FRET效率对比;601+39核小体甲基化前后偶极子取向角变化;conclusion;首创性
单分子检测;QUESTION;
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