第3章 Diamond.ppt

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第3章 Diamond

【实例3-8】试在Diamond3.0软件中展示并观察五氧化二磷分子晶体的结构,并为其添加多面体结构。 五氧化二磷分子晶体的结构原图位于Diamond2.1版本软件 (路径为Diamond2\Samples\Tutorial\)的P4O10.cry文件 安装Diamond2.1 三种打开导入方式 : 1)Creat a picture automaticaly (直接自动打开文件中所保存的结构图形) 2)Launch the Picture Creation Assistant (启用创建图形的辅助对话框) 3)Create a blank picture (创建空白图形) ★若要清楚了解五氧化二磷分子晶体的连接情况, 选择Create a blank picture (创建空白图形) : 显示一个晶胞中所有原子 将相互有关联的原子连接起来 逐步显示所创建原子的周围连接情况。 创建第一个原子 得到文件中所保存的原始结构图形 直接得到分子结构 Picture工具栏的使用 Olivine橄榄石 化学通式是R2[SiO4],晶体属正交(斜方)晶系的一族岛状结构硅酸盐矿物的总称。因常呈橄榄绿色而得名。化学式中的R主要为二价阳离子镁、铁、锰。用于冶金、珠宝业。 Topaz黄玉 化学组成为Al2[SiO4][F,OH]2,晶体属正交(斜方)晶系的岛状结构硅酸盐矿物。用于硅酸盐工业。 ※结合Diamond软件,利用化学知识,可加深对有关矿物晶体的了解。 利用Diamond软件对晶体结构的展示 Open/Diamond3/Samples/Minerals(39种晶体结构*.dsf文件) 沸石 石墨 钙钛矿 黄玉 橄榄石 石英 锐钛矿 莹石,氟石 黄铁矿 金红石 分子硫 氯钙石 CaCl2 1、观察橄榄石的结构。 (在同一晶体中构建不同形式的多面体) Diamond3/Samples/Minerals/Olivine.dsf 练习: (利用Picture 工具栏重新构建) 要求:先消除,重新构建两种形式多面体 分别以Si、Mg为中心 2、构建分子烯(C60)的结构。 Diamond3/Tutorial/C60.cif 创建多面体结构需要一个中心原子 (1)需要首先添加上一个“虚拟原子” Ctrl+A选中所有的对象 Structure(结构)/ Insert atom...命令 (2)进入多面体设置 : (限制多面体范围1~5埃) Build/ Polyhedra/ Add Polyhedra命令 (3)将虚拟原子设为透明 问题:能否创建多面体? 3、观察石英的结构 Diamond3/ Samples/Minerals /quartz.dsf 4、分析钙钛矿的结构。 Diamond3/Samples/Minerals/ perovskite.dsf 5、构建并观察石墨的格子状结构。 Diamond3/Samples/Minerals/graphite.dsf 要求:先消除, 再重新构建(多面体) 石墨烯(Graphene) 石墨烯是一种二维晶体,是一种从石墨材料中剥离出的单层碳原子面材料,是碳的二维结构。这种石墨晶体薄膜的厚度只有0.335纳米。它是2004年由曼彻斯特大学的科斯提亚?诺沃谢夫和安德烈?盖姆小组首先发现的。这种神奇材料的诞生使他们获得2010年诺贝尔物理学奖。 石墨烯具有非同寻常的导电性能、超出钢铁数十倍的强度和极好的透光性,它的出现有望在现代电子科技领域引发一轮革命。 试利用Diamond3.0构建石墨烯的晶体结构,为其设置材质和相应的彩色背景,并导出图片。 分别打开Diamond2.1版本中BORON.CRY,GaPt2.CRY,HITTORF.CRY[红P]文件,重新构建及观察晶体的内部结构。 练习 制作金属晶体(Cu)的密堆积方式 将晶体的模式(Model)设为标准的球棍模式(Ball and Stick) 用Diamond提供的测量键长工具(Measure Distances),测量出两个原子之间的距离,再除以2,以此改变原子半径 选择菜单Picture中的Atom Disigns…命令,在弹出的对话框中,点击Model and Radii标签,输入新的半径(Radius),则晶体显示出密堆积形态。 3.6 其他功能介绍 3.6.1 对未知结构进行研究 【实例3-9】科学家在研究某矿石时,由原子探测仪得

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