基于有序条件互信息和有限父结点构建基因调控网络.PDFVIP

生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biop hys ics 2017, 44(5): 443~450 于有序条件互信息和有限父结点 构建 因调控网络* 刘飞1, 2) 张绍武1)** 高红艳2) 1) 2) ( 北工业大学自动化学院，信息融合教育部重点实验室，西安710072； 宝鸡文理学院物理与光电技术学院，宝鸡721016) 摘要 基因调控网络重建是功能基因组研究的基础，有助于理解基因间的调控机理，探索复杂的生命系统及其本质 针对传 统贝叶斯方法计算复杂度高、仅能构建小规模基因调控网络，而信息论方法假阳性边较多、且不能推测基因因果定向问题 本文基于有序条件互信息和有限父结点，提出一种快速构建基因调控网络的OCMIPN 算法 OCMIPN 方法首先采用有序条 件互信息构建基因调控相关网络；然后根据基因调控网络拓扑先验知识，限制每个