基于SCoT 标记的芥菜种质遗传多样性与指纹图谱.pdfVIP

中国蔬菜　2013（12）：31-39 CHINA VEGETABLES 基于SCoT 标记的芥菜种质遗传多样性与指 纹图谱 1，2 1 2 1 1 3 1 林　清 　龙治坚 　韩国辉 　何　桥 　向素琼 　范永红 　唐佳佳 梁国鲁1* 1 2 （ 西南大学园艺园林学 院，重庆 400716； 重庆市农业科学院，逆境农业研究重庆市市级重点实 3 验室，重庆 401329； 重庆市涪陵区农业科学研究所，重庆 408000） 摘　要：利用 SCoT 标记对 46 份芥菜种质资源进行遗传多样性分析。从 70 条引物中筛选出 21 条用于 PCR 扩增，共扩增出 200 条条带，其中多态性条带 140 条，多态性比率为 70%。供试材料相似系数介于 0.77～0.95 之间，平均 Nei’s 基因多样性为 0.198，平均 Shannon 信息指数为 0.301，平均多态信息含量为 0.822 7。利用 UPGMA 构建 46 份芥菜种质资源的聚类树状图，在相似系数 D1=0.780 处，可以将 46 份芥 菜种质分为两大类；而在 D2=0.807 处，第Ⅱ类可进一步细分为 5 个亚类。选出清晰的 16 个多态性位点， 构建 46 份芥菜种质的 SCoT 指纹图谱，结果由引物 SP4、SP19、SP20、SP23、SP30 所构建的 DNA 指纹 图谱可将供试材料完全区分开。 关键词：芥菜；SCoT 标记；遗传多样性；指纹图谱 中图分类号：S637　　文献标识码：A　　 文章编号： 1000-6346（2013）12-0031-09 Genetic Diversity and Fingerprint Based on SCoT Markers in Brassica juncea （ ） L. Czern. et Coss. 1，2 1 2 1 1 3 LIN Qing ，LONG Zhi-jian ，HAN Guo-hui ，HE Qiao ，XIANG Su-qiong ，FAN Yong-hong ， 1 1* TANG Jia-jia ，LIANG Guo-lu 1 College of Horticultural and Landscape Architecture Southwest University Chongqing 400716 China （ ， ， ， ； 2 Chongqing Academy of Agricultural Sciences，Chongqing City Key Laboratory of Adversity Agriculture，Chongqing 401329，China；3Fuling District Agricultural Science Institute of Chongqing City ，Chongqing 408000，China ） Abstract ：SCoT markers were used to analyze genetic diversity of 46 mustard accessions．21 primers were screened from 70 SCoT primers and 200 SCoT bands were obtained，including 140 poly- morphic bands，with a polymorphism rate of 70%．The genetic similar