杨凌番茄黄化曲叶病毒外壳蛋白基因的克隆与其核心序列分析.pdfVIP

中国蔬菜　2013（4）：38-45 CHINA VEGETABLES 杨凌番茄黄化曲叶病毒外壳蛋白基因的克隆 与其核心序列分析 * 李云洲　梁　燕 　王巧丽　李　翠　崔　霞　秦　蕾 （西北农林科技大学园艺学院，陕西杨凌 712100） 摘　要：以陕西杨凌番茄生产基地感病（TYLCV 症状）番茄植株为材料，分离得到杨凌番茄黄化曲叶 病毒分离物，命名为 TYLCV-Yl（GenBank 序列号：KC293824，未公布）；克隆该病毒外壳蛋白全基因序 列 CP 及其核心序列 tCP ；分析核心序列 tCP 的特征、 进化特征；运用 DNAMAN 多重比较了该病毒外壳蛋 白序列与其他 18 个 TYLCV-CP 核苷酸序列并且构建了基于 CP 基因核苷酸序列的进化树。结果表明：获 得杨凌番茄黄化曲叶病毒（TYLCV-Yl）分离物，确定杨凌番茄黄化曲叶病毒源；获得 TYLCV-Yl CP 全 基因序列核心序列 tCP ，为基于 CP 抗 TYLCV 奠定基础；tCP 核心序列非常保守，长度为 419 bp，编码 137 个氨基酸，其中在 79～97 个氨基酸之间具有 1 个跨膜结构；基于 CP 基因构建的进化树可将番茄黄 化曲叶病毒分为 3 个亚组：TYLCV 亚组Ⅰ，TYLCV 亚组Ⅱ，TYLCV 亚组Ⅲ，其中杨凌番茄黄化曲叶病毒 （TYLCV-Yl）属于 TYLCV 亚组Ⅰ。 关键词：番茄黄化曲叶病毒；杨凌番茄黄化曲叶病毒分离物；克隆；序列分析 + 中图分类号：S436.412.1 1　　文献标识码：A　　 文章编号： 1000-6346（2013）04-0038-08 Clone and Core Sequence Analysis on CP Gene of TYLCV Isolate from Tomato in Yangling * LI Yun-zhou，LIANG Yan ，WANG Qiao-li，LI Cui，CUI Xia，QIN Lei College of Horticulture Northwest A F University Yangling 712100 Shaanxi China ） （ ， ， ， ， Abstract ：Taking the tomato plants with TYLCV symptom obtained in Yangling tomato production base and named TYLCV-Yl（GenBank accession：KC293824）as material，we cloned the full coat CP tCP protein gene （ ） and the core part（ ）of coat protein gene of the TYLCV-Yl isolate and analyzed the sequence features and tCP evolutionary character．Multiple comparison of this virus full coat protein sequence with other 18 TYLCV-CP nucleotide sequence and constructed evolutionary tree based on CP gene nucleotide sequence using DNAMAN software．The results indicated that the tomato yellow leaf curl virus isolation （TYLCV-Yl）obtained in Yangling was confirmed as the resource of TYLCV-Yl． We also acquired the full gene sequence of coat protein of TYLCV-Yl，which lay foundation for resis- tance based