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代谢组学的研方法和研究流程
代谢组学的研究方法和研究流程
生物化学与分子生物学
林 兵
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主 要 内 容
定义
概述
特点
研究方法
研究流程
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定 义
代谢组学(metabonomics)是指通过组群指标分析,进行高通量检测和数据处理,研究生物体整体或组织细胞系统的动态代谢变化,特别是对内源代谢、遗传变异、环境变化乃至各种物质进入代谢系统的特征和影响的学科。
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概 述
代谢组学是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式,是系统生物学的组成部分。
其研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。
先进分析检测技术结合模式识别和专家系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。
其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。
主要技术手段是核磁共振(NMR)、质谱(MS)、色谱(HPLC,GC),其中以NMR为主
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特 点
关注内源化合物
对生物体系的小分子化合物进行定量定性研究
上述化合物的上调和下调指示了与疾病、毒性、基因修饰或环境因子的影响
上述内源性化合物的知识可以被用于疾病的诊断和药物筛选。
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代谢组学的研究方法
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真正意义的代谢组学研究。预处理和检测技术需满足高灵敏度、高选择性和高通量的要求。需要对获得的数据进行解析。
代谢产物分析4个层次
代谢物靶标分析。对个别特定组分分析。
代谢轮廓分析。对预设组分的分析。
代谢组学。特定样品中所有代谢物分析。
代谢指纹分析。比较代谢物指纹图谱。
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目前最常用的分离分析手段是:
气相色谱与质谱联用(GC—MS)
液相色谱与质谱联用(LC—MS)
毛细管电泳与质谱联用(CE—MS)
核磁共振(NMR)
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GC-MS
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气相色谱原理:气相色谱的流动向为惰性气体,气-固色谱法中以表面积大且具有一定活性的吸附剂作为固定相。当多组分的混合样品进入色谱柱后,由于吸附剂对每个组分的吸附力不同,经过一定时间后,各组分在色谱柱中的运行速度也就不同。吸附力弱的组分容易被解吸下来,最先离开色谱柱进入检测器,而吸附力最强的组分最不容易被解吸下来,因此最后离开色谱柱。如此,各组分得以在色谱柱中彼此分离,顺序进入检测器中被检测、记录下来。
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质谱原理:质谱分析是一种测量离子荷质比(电荷-质量比)的分析方法,其基本原理 是使试样中各组分在离子源中发生电离,生成不同荷质比的带正电荷的离子,经加速电场的作用,形成离子束,进入质量分析器。在质量分析器中,再利用电场和磁场使发生相反的速度色散,将它们分别聚焦而得到质谱图,从而确定其质量。
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GC-MS的基本流路图
GC
接口
MS
数据处理
真空系统
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GC-MS联用仪器
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优点:集色谱法的高分离能力和
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