棉花阿拉伯半乳糖蛋白基因的克隆尧表达及染色体定位分析.PDF

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棉花学报 Cotton Science 2010, 22(1):23-29 花阿拉伯半乳糖蛋白基因的克隆 表达与染色体定位分析 王磊 田亮亮 朱一超,蔡彩萍 赵 亮 张天真 郭旺珍 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室袁江苏南京210095冤 摘要院陆地棉李氏超短纤维突变体 冤是显性单基因突变体袁表现为茎秆尧叶片卷曲袁纤维短至6 mm 袁其隐 性纯合体 冤则表现为株型和纤维发育都正常遥 对开花后10 d 的李氏纤维发育正常材料 冤和超短纤维 突变体 冤胚珠纤维混合体进行mRNA 差异显示反转录PCR DDRT-PCR 冤分析袁获得 1 条在李氏纤维发 育正常材料中上调表达的差异片段遥进一步通过5RACE 技术获得全长为62 1 bp 的cDNA 袁测序及DNA 序列 的生物信息学分析表明该cDNA 片段与拟 芥编码阿拉伯半乳糖蛋白基因 14 有52%相似性袁 故命名为 遥 表达特征分析表明袁该基因在陆地棉根尧茎尧叶和纤维中组成性表达袁在棉纤维中优势表达遥 基因组序 列分析显示袁该基因在二倍体棉种非洲棉和雷蒙德氏棉中各有1 个拷贝袁在四倍体棉种陆地棉TM-1 和海岛 棉海7 124 中分别存在2 个拷贝袁表明A 尧D 亚组中各有1 个拷贝遥 利用本实验室陆地棉遗传标准系TM-1 和 海岛棉海7 124 培育的含 140 个单株的BC1 作图群体袁 将 基因的2 个拷贝分别定位在四倍体棉花部 分同源转化群染色体6 和染色体25 上遥 关键词院棉花曰纤维突变体曰阿拉伯半乳糖基因曰克隆曰表达曰基因定位 中图分类号院S562.035 文献标识码:A 文章编号:1002-7807 2010冤0 1-0023-07 WANG Lei, TIAN Liang-liang, ZHU Yi-chao, CAI Cai-ping, ZHAO Liang, ZHANG Tian-zhen, GUO Wang-zhen ( 210095 ) The Ligon lintless mutant ( ) is a fiber elongation developmental mutant with a dominant monogenetic mutation characterized by short fibers and distorted leaf, stem and flower growth, and the recessive pure line ( ) exhibits normal fiber developmental characteristics. The obj ectives of this study were to isolate genes preferentially or specifically expressed in fiber elongation stage by comparing gene expression differences between and . RNA isolated from 10 days post anthesis (DPA) fibers and ovules mixture in and were used to screen differential gene expression in fiber development using differential display reverse transcriptase polymerase chain reaction DDRT-PCR). One differential

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