第九讲基因组学与蛋白质组学(2017.4).pptVIP

本章小结： 1.HGP的含义。 2.人类基因组计划的主要内容、任务及意义。 3.基因、基因组、基因组学的概念。 4.蛋白质、蛋白质组与蛋白质组学的概念。 5.蛋白质组学研究的主要内容及方法。 6.基因组与蛋白质组的比较。 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * w2 * 据统计，蛋白质在翻译后大约有200种的修饰形式，如磷酸化、糖基化、乙酰化、烷基化等，这些变化不仅改变了蛋白质的空间构象，而且，往往是蛋白质发挥功能的活性基础。由于单基因病仅占所有疾病的2%左右，大多数疾病都是发生在蛋白质水平，因而利用蛋白质组学技术，借助研究蛋白质的表达丰度、性质和相互作用，我们就可以进一步探索疾病的诊疗方法和药物的开发。 对生命现象的研究有三个水平：基因组、转录组（RNA）和蛋白质组，基因组告诉我们理论上将会发生什么，转录组告诉我们可能会发生什么，蛋白质组则告诉我们正在发生什么。 蛋白质是生命活动的真正执行者，细胞是生命活动的基本单位。基因和蛋白质的功能最终必须在细胞中整合起来并得以真正体现。基因好比一张制造火车的图纸，蛋白质就是根据图纸制造的真正有运输能力的火车。虽然目前已完成了对人类基因的全部DNA序列测定，但是单凭制造火车的图纸,还不会跑起来,也不可能实现物资和旅客的运输任务。 二、为什么要进行蛋白质组研究? 以疯牛病和人类克雅病（Creutsfeldt-disease,CJD）为代表的可传染性海绵状脑病（transmissible spongi-form encephalopathies,TSE）为一类致死性神经系统疾病。其感染因子是一种与正常细胞膜蛋白（PrPC）一级结构完全相同，但高级结构、理化特性不同的PrPSc或prion蛋白（阮蛋白？）。目前的研究提示，这种不含有核酸的prion蛋白似乎具有自身复制的能力，也就是说这种蛋白本身就储备了生命活动必需的遗传信息。 这就提示我们，在自然界中可能还存在着一种全新的微小生命体—— 一种无核酸的微小生物体。从而改变人类对整个生物界的认识。即蛋白质不仅可体现生物学功能，而且可储存遗传信息。而核酸成分可能在prion复制过程中完全缺如，这将有力地挑战目前的“生物中心法则”。PrP蛋白高级结构的改变不仅可造成蛋白质功能的变化，在某种意义上还是遗传信息传递的方式。 三、蛋白质组和蛋白质组学概念 蛋白质组一词由澳大利亚科学家Wilkins和Williams在1995年7月首次提出。蛋白质组（proteome）一词，源于蛋白质（protein）与 基因组（genome）两个词的复合，意思是Proteins expressed by a genome，即由基因组表达的蛋白质,是指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。 实际上，它有3种不同的含义： 1个基因组、1种生物或1种细胞所表达的全套蛋白质。 蛋白质组是一个动态的概念…… 蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础，也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。 蛋白质组学(Proteomics)——以蛋白质组为研究对象的崭新研究领域。 蛋白质组学提供了一套在蛋白质水平大规模研究基因功能的有用工具。它旨在阐明生物体全部蛋白质的表达模式和功能模式，其内容包括蛋白质表达、存在方式、结构、功能和相互作用等。 四、蛋白质组学研究的技术路线 蛋白质组学是以蛋白质为研究对象的崭新研究领域。 主要采取以下技术路线： 蛋白质组技术 2D-Electrophoresis （双向电泳） ? Mass spectrometry Bioinformatics （质谱分析） （生物信息学） 样品提取（生物体组织、细胞、体液） ICAT 全景式蛋白质 定量技术 离心，LC纯化 纯 化 BioCAD多维色谱 图像分析 2-D Gel PVDF膜 SPOT切割 SDS酶 解 多肽片段 173A毛细管HPLC纯化及样品制备 纯化 BioCAD纯化系统 SYMBIOTI 样品处理系统 PROCISE蛋白测序仪 飞 行 时 间 质 谱 仪 VOYAGER STR MALDI-TOF ESIQq-TOF ESI-TOF 肽序列测定 肽指纹谱PMF 蛋白质信息数据库检索 ABI Informatics 蛋白识别（PROTEIN ID） 五、蛋白质组学研究的意义 1.基因功能的信息通过基因所编码的蛋白质表现，蛋白质为生物功能的执行