细菌泛基因组学的研究_庄绪冉.pdfVIP

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2017-06-25 发布于浙江
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细菌泛基因组学的研究_庄绪冉

( ) 上海交通大学学报医学版 ·1440 · Journal of Shanghai Jiaotong University (Medical Science) Vol． 32 No． 11 Nov． 2012 ［］ 1674 -8115 (20 12)11-1440-04 · · 文章编号综述细菌泛基因组学的研究，庄绪冉朱泳璋 ( ， 200025) 上海交通大学基础医学院病原生物学教研室上海［］，，摘要细菌是自然界中最古老的生物种群之一不同菌种之间甚至是同一种菌的不同株系之间也具有丰富的遗传多样性在，。表型特征上具有明显分化这些分化的遗传基础主要源自菌株之间的基因组遗传信息的差异为了更全面地在基因组水平上，，揭示细菌种内个体间的遗传多样性进一步探寻个体间的系统发生关系和个体间表型差异的遗传基础科学家提出了细菌泛基，、。因组学的概念该文对细菌菌种遗传多样性的形成机制泛基因组的研究策略及其在细菌研究中的应用和进展等作一综述［］ ; ; ; ; 关键词泛基因组多菌株测序遗传多样性核心基因组附属基因组［DOI］10 ． 3969 /j ． issn． 1674-8115 ． 2012 ． 11． 010 ［］Q936 ［］A 中图分类号文献标志码 Research progress of bacterial pan-genome ZHUANG Xu-ran ， ZHU Yong-zhang ( Dep artment of Medical Microbiology and Parasitology ， Basic Medical College ， Shanghai Jiaotong University ， Shanghai 200025 ， China) ［Abstract ］ Bacterium ， one of the most ancient organisms ， has great diversity and obvious differentiation in phenotype among different strains and even in different lines of one strain． The hereditary basis of differentiation is due to the genomic genetic information difference among different strains． In order to illustrate the individual genetic diversity and explore the hereditary basis of individual phylogenesis and phenotype difference ， the concept of pan-genome is put forward． The causes of heredi