生物医学文献知识发现研究探讨及展望 - 复杂系统与复杂性科学.pdfVIP

维普资讯 第 1卷第3期 复 杂 系 统 与 复 杂 性 科 学 Vo1．1 No．3 2004 年 7月 COMPLEXSYffrEMSAND COMPL]DLrI~ SCIENCE Ju1． 2OO4 文章编号 ：1672—3813(2004)03—0045—11 生物医学文献知识发现研究探讨及展望 周雪忠 ，吴朝 晖 ，刘保延 (1．浙江大学计算机学院，浙江 杭州 310027；2．中国中医研究院，北京 10o70o) 摘要：采用文本挖掘技术处理海量生物医学科技 文献和文本注释 型数据库 ，从而发现创新知识 如基 因、蛋 白质 、疾病、药物及其相互关系的研 究是 当前人工智能和数据挖掘领域研 究的热点。 本文对生物 医学文献知识发现的研 究内容、研究成果以及基于文本挖掘 的关键技术诸方面进行 了系统的分析和 阐述。通过分析 中医药学数据的特点。提 出了基于文本挖掘 的中医证候分子生 物学知识发现研究，该方法的特点是综合利用中医药学文献和 MEDLINE，能够获得创新 的证候 与基 因相关知识。初步实验表明，文本挖掘技术有望为证候 的分子水平研 究提供辅助和支撑手 段 。 关键词 ：文本挖掘 ；文献知识发现 ；生物 医学；中医药 中图分类号 ：TP39；R2；Q7 文献标识码：A KnowledgeDiscoveryinBiomedicalLiterature：SurveyandProspect ZHOU Xue．zhong ，W U Zhao．hui，LIU Baoyan (1．CollegeofComputerScience，ZhejiangUniversity。Hangzhou310027，China； 2．ChinaAcademyofTraditionalChineseMedicine，Beijing1O07O0 ，China) Abstract：Usingtextminingmethodstoprocesshugebiomedical literatureandtextnanotationdatabasesfordiscoveryof novelscientificknowledgesuchasgene，protein，disease，drugna dtherelationshipamonghtem ，has beenhtefociinarti- ficialintelligenceanddataminingresearchfields．Thelatestresearchesofbiomedical literatureknowledgediscovery ，inclu— dingmain issues，accompli8hment，andhte keymehtodsfrom textminingperspective，arediscussed．Furthermore，this paperproposesatextminingbasedapproachtofindthemolecularlevelknowledgeofSymptom Complex．Thisapproachin- tegratesthetraditional Chinesemedical literature and MEDLINE，andpromisestodiscovernovelknowledgeabouttherela- tionshipbetween Symptom Complexan