猪源冠状病毒ORF3和ORF7的克隆及特性分析.pdfVIP

2007年 l2月 甘 肃 农 业 大 学 学 报 第 4 2卷 第 6期1～7 JOURNAL OF GANSU AGRICULTURAL UNIVERSITY 双 月 刊 猪源冠状病毒ORF3和ORF7的克隆及特性分析 李建强 一，柳纪省 ，程 杰 ，兰 喜 ，胡永浩 ，吴 润 ，殷相平 ，李宝玉 (1．中国农业科学院兰州兽医研究所，家畜疫病病原生物学国家重点实验室，农业部畜禽病毒学重点开放实验室， 甘肃兰州 730046；2．甘肃农业大学动物医学院，甘肃兰州 730070) 摘要：参照GenBank中Purdue株全序列对TGEV(猪传染性胃肠炎病毒)TS株的ORF3和ORF7各设计l对 特异性引物．经RT—PCR扩增分别获得了l 487 bp和516 bp大小的两个片段，与预期结果大小相符．TS株与 CHV株、Puedue株、BW021898B株和KT2株的ORF3a核苷酸序列同源性分别为99．1％、93．0％、95．9％、 94．4％．相应的氨基酸同源性分别为97．3 、87．8 、93．2 、91．8％，TS株与 CHV株、Puedue株、BW021898B 株和KT2株的ORF3b核苷酸序列同源性分别为99．5％、98．5 、97．0 、97．8％，相应氨基酸的同源性分别为 98．4 、96．3 、94．3％、95．8％，而TS株与PRCV IA1894株的ORF3b核苷酸和氨基酸同源性分别为96．6％ 和93．9 ．TS株 ORF7没有发生缺失且和其他毒株有很高的同源性．结果表明：TGEV非结构蛋白高变区在 ORF3a第192个碱基至终止密码子之间．TGEV和PRCV在编码ORF3b氨基酸的数量和RNA酶结合位点上有 一 定的差异． 关键词：猪源冠状病毒；传染性胃肠炎病毒；ORF3；ORF7；克隆 中图分类号：S 851．347．i01 文献标识码：A 文章编号：1003—4315(2007)06—0001—07 Cloning and characterizati0n of ORF3 and ORF7 of porcine c0r0naV1rus LI Jian—qiang ，LIU Ji—xing ，CHENG Jie ，LAN Xi ，HU Yong—hao。， WU Run。。YIN Xiang—ping ，LI Bao—yu (1．Key Laboratory of Animal Virology of Ministry of Agriculture，State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology。Lanzhou Veterinary Research Institute．Chinese Academy of Agricultural Sciences．Lanzhou 730046．China； 2．College of Veterinary Medicine，Gansu Agricultural University，Lanzhou 730070，China) Abstract：Two non—structural protein genes of strain TS of transmissible gastroenteritis virus (TGEV)，ORF3 and ORF7 were obtained by RT—PCR using primers designed according to Purdue nucle— otide sequence in the GenBank，with the length of 1 487 bp and 5 1 6 bp respectively．The homology at the nucleotide levels for the ORF3a gen