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インタラクトームとしてのDynamical Networks 我らオーム主義者なり (K.Nakai) 鈴木泰博、荻島創一、長谷武、中川草、田中博 東京医科歯科大学 大学院疾患生命科学研究部　生命情報学 （ATRは今年度（平成15年）末まで） Agenda Back ground 1 What’s DNA and protein? Back ground 2 我らオーム主義者なりby Nakei.K bio-networks as interactome Quick View Dynamical networks と分子生物学 出芽酵母のタンパク相互作用ネットワークについて 最後に（創薬?医療とinteractome） はじまりのはじまり DNAそれはバイブルのバイブル 複数の遺伝子間ではネットワークを形成する “やんごとなき”たんぱく質の生涯揺り篭から墓場まで 社会システムとしての細胞 Agenda Back ground 1 What’s DNA and protein? Back ground 2 我らオーム主義者なりby Nakei.K bio-networks as interactome Quick View Dynamical networks と分子生物学 出芽酵母のタンパク相互作用ネットワークについて 最後に（創薬?医療とinteractome） OVER VIEWinteract-ome (biology] H.Pyloriのタンパク相互作用ネットワーク flyDrosophia melanogaster classic①A network of protein-protein interactions in yeast (Schwikowski et al. 2000) A network of protein-protein interactions in yeast (Schwikowski et al. 2000) A network of protein-protein interactions in yeast (Schwikowski et al. 2000) 最近の流れ 新たなスクリーニングの方法 （HMS-PCI法の応用） High-throghput mass spectrometric protein complex identification他にTAP法などが応用されるようになってきた。 インタラクトームclassic② 相互作用の最適化制御 Agenda Back ground 1 What’s DNA and protein? Back ground 2 我らオーム主義者なりby Nakei.K bio-networks as interactome Quick View Dynamical networks と分子生物学 出芽酵母のタンパク相互作用ネットワークについて 最後に（創薬?医療とinteractome） OVER VIEWineract-ome [数理＆biol.] Biological networksの統計的性質 遺伝子ネットワークのスクリーニング グラフ理論の応用 プロテインネットワークの進化 無理やりまとめてみると。。 Agenda Back ground 1 What’s DNA and protein? Back ground 2 我らオーム主義者なりby Nakei.K bio-networks as interactome Quick View Dynamical networks と分子生物学 出芽酵母のタンパク相互作用ネットワークについて 最後に（創薬?医療とinteractome） レポート課題ネットワーク生物学 従来の関連研究Specificity in topology in the yeast protein network (Maslov, Science, 2002) Yeast 2 Hybrid system (Y2H) WHY　OUT-IN = 1？　（やったこと①） シミュレーション（初期分布の設定） 結合後のOut－In degreeの分布 細胞内局在で分けたインタラクションとコンプレックス形成 細胞質と核内タンパク質 中程度の相互作用(10-30interactions)はcomplex形成に関与する割合が高いことが確認された. 特に核内でがComplex形成に関与する相互作用が多い 出芽酵母タンパクネットワーク 今後のチャレンジ　創薬?臨床へ Power of two links? PPI networks Tea