中国药物研发的新机遇：关于医药大数据的系统性药物重定位.pdfVIP

2014 年 第 59 卷 第 18 期： 1790 ~ 1796 《中国科学》杂志社 论 坛 SCIENCE CHINA PRESS 中国药物研发的新机遇: 基于医药大数据的系统性 药物重定位 ① ② ① ③ ①* 王可鉴 , 石乐明 , 贺林 , 张永祥 , 杨仑 ① 上海交通大学Bio-X 研究院, 上海 200095; ② 复旦大学药学院, 药物基因组学研究所, 上海 201203; ③ 军事医学科学院毒物药物研究所, 北京 100850 * 联系人, E-mail: ylemcreast@ 2013-06-21 收稿, 2014-03-09 接受, 2014-05-27 网络版发表 摘要 在科研资源相对有限的前提下, 如何提高药物研发的投入产出比, 最终为全社会提供 关键词 安全、有效和廉价的药品, 是一个对我国生物医药基础和应用研究均具有重大意义的问题. 面 医药大数据 对国际上原创新药研发投入逐年增高且失败风险逐年增大的趋势, 挖掘已有药物新的适应症 药物重定位 ( 旧药新用或药物重新定位) 能够在一定程度上有效规避研发风险、降低研发成本、加快药物上 旧药新用 转化医学 市的步伐从而迅速满足临床用药需求, 因而成为众多国际制药企业重视和采用的一种战略. 随 新药研发 着药物生物信息学的发展, 药物重定位策略正从依赖临床观察的经验性研究, 朝着基于大规 计算生物学 模组学和医药大数据分析的系统性研究转变. 本文将着重介绍国际上一系列用于挖掘和指导 生物信息学 药物重定位的医药大数据挖掘方法, 如基于基因表达谱联系图、全基因组关联分析、化合物- 蛋白互作组、药物副作用等. 参考和借鉴上述各种前沿技术, 将有助于我国科研工作者开发和 改进适应我国国情的药物重定位技术, 特别是中药的适应症拓展, 从而为我国带来社会和经 济效益. 目前的药物研究与开发主要遵循“化合物—靶蛋 应用, 需要走过一条异常漫长艰辛的道路, 而且其中 白—表型变化—疾病治疗”这一中心原则, 即设计具 的每个步骤都存在着前功尽弃的失败风险. ( ⅰ) 新 有特定结构的化合物, 使其特异性地结合体内的某 药开发所涉及的研究方法、技术条件和项目管理都十 些蛋白的活性位点, 从而有效改变服药者的生理状 分复杂, 不仅需要庞大的研究队伍, 而且还要依赖于 态, 最终发挥药物对适应症的预期疗效. 通常情况下, 项目中各部分积极有效的协作, 其中任何一个环节 经过长期的生物学和临床医学的研究, 相关领域的 出现失误或意外都有可能对开发项目造成重大的负 专家能够积累针对某一特定疾病的大量知识, 可基 面影响[2], 这也就使新药开发具有极大的不确定性和 于此寻找到在病理通路中发挥核心作用的一系列药 风险性[3]; ( ⅱ) 正因为新药开发项目往往周期长, 条 靶蛋白. 围绕靶蛋白可以设计和筛选相匹配的药物 件严格, 也就意味着十分高昂的成本投入[4], 但大多 分子, 而后通过大规模的临床试验,