作物育种14分子标记辅助选择（2学时）.ppt

(GC)n (CG)n (CG)n (GC)n ISSR引物有两种类型：1）直接用简单重复序列本身作引物；2）利用简单重复序列的本身在3ˊ或5ˊ末端加上2～4个锚定碱基作为引物，从而克服有的简单重复序列本身作为引物扩增时产生带型模糊现象。 基本原理：STS是指基因组中长度为200-500bp，且核苷酸顺序已知的单拷贝序列，通过PCR可将其专一扩增出来。其基本原理是，依据两端序列，设计合适的引物，进行PCR扩增，电泳显示扩增产物多态性。 STS标记的主要特点：（1）标记来源广，数量多；（2）共显性遗传，可区分纯合子和杂合子；（3）技术简便，检测方便；（4）与SSR标记一样，开发依赖于序列分析及引物合成，成本较高；（5）多态性常常低于相应的RFLP标记。 2.6 Sequence tagged site（STS，序列标定位点） 基本原理：染色体基因组水平上某个特定位置单碱基的置换、缺失、或插入引起的序列变异。 STS标记的主要特点：（1）标记来源广，数量多；（2）高度稳定； （3）直接产生基因表达或蛋白的变化； 2.7 single nucleotide polymorphism （SNP，单核苷酸变异） 基本原理：功能性分子标记基于功能基因基序 （motif）中功能性单核苷酸多态性（SNP）位点开发 而成 主要特点（1）更有效地固定群体中的等位 基因；（2）有助于控制平衡选择；（3