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Materials Studio 简介 有关 M S Materials Studio是美国Accelrys公司推出 的一款商业化的计算机模拟软件，该公司 结合大量的生物，化学，药物，材料和化 工数据库，推出了一系列计算机软件，其 中与计算化学与材料相关的软件主要包括 Cerius2和Insight Ⅱ以及MS，而前两种软 件目前只能在IBM或SGI服务器上运行，只 有MS允许在PC运行 MS支持Unix ，Windows ，Linux等多种操作系 统。但是MS为模块结构的软件，目前有12个 功能模块，不同的模块对操作系统的要求不 尽相同，不过我们常用的Windows XP对所有 功能模块均支持。 MS到目前为止的最高版本为4.1版，从MS2.0 版开始已经支持并行计算，计算能力强大 各模块对操作系统的要求 MS的功能模块 目前MS共推出了12个功能模块： Materials Visualizer，Amorphous Cell ， CASTEP，COMPASS，Dmol3，DPD，Equilibria， Forcite，Mesodyn，Reflex，Reflex Plus，VAMP 上述模块主要采用MM，MC，MD，以及量子力 学（DFT，ab-initial ）等方法，应用领域涵盖生命 科学，药物设计，高分子聚合物，材料科学，固态 化学，表面化学，光谱模拟，生物化学，生化分子 结构分析等。 Materials Visualizer Materials Visualizer是Materials Studio的核 心模块，它提供了快速直观的工具，使你能 构造分子、晶体材料、表面、界面、层结构 和高聚物的图形模型。你能操纵、查看并分 析这些模型。Materials Visualizer也处理图 表、表格和文本数据，提供软件基础和分析 工具，以支持所以的Materials Studio产品。 有机小分子 聚合物 Polymer builder : 提供丰富 Sketching : 草画原 的单体数据库，自定义单体， 子，多元环，键型， 构建均聚物，共聚物（无规， 加氢,clean 交替，嵌段），树枝型聚合物 晶 体 表 面 Crystal builder : 晶胞参 Cleave surface : 各个晶面， 数，原子座标，空间群对 Vacuum , supercell, 称性 primitive cell 其他文档格式 CASTEP模块 CASTEP基于总能量的平面波赝势理论，运用 原子数目和种类来预测包括晶格参数、分子 对称性、结构性质、能带结构、固态密度、 电荷密度和波函数、光学性质。 CASTEP的新功能 Dmol模块 Dmol3 是独特的密度泛函理论量子力学软 件，可以研究气相、溶液、表面和固体系 统。由于它独特的静电学近似，Dmol3一直 是最快的分子密度泛函计算方法之一，使用 非局域化的分子内坐标，可以快速优化分子 和固体系统的结构。使用LST/QST算法和共 轭梯度结合，Dmol3可以有效地搜索过渡 态，避免了耗时的黑塞矩阵的计算。过渡态 搜索功能可以应用于分子和周期系统。 Dmol3 的新功能 CASTEP与Dmol3比较 CASTEP的DFT计算是以精确的量子力学ab- initial为基础的，结合分子动力学模拟及固 态理论，结果通常比较准确，但是耗费机时 较多。 Dmol3的密度泛函是以数值型态表示原子基 底函数，并能以变化内坐标的方式快速处理 结构优化的计算，计算速度块，但精度一般 不如CASTEP