婴儿生后粪便生物区系的演变.pdf

目 录 中文摘要……………………………………………………………………1 英文摘要……………………………………………………………………5 英文缩写……………………………………………………………………9 研究论文婴儿生后粪便微生物区系的演变 前言……………………………………………………………………lO日lJ舀”一…“”一”“””“一””一“”””“一”…”“…”“一一”“…””一”10 材料与方法……………………………………………………………11 结果……·…····…····………···…………··…··········………………16 附图···········································…································2l 附表………………………………………·…………………………··29 讨论··············································································31 O OO DOOO…···……………0O DOO 0…······……···…………………36 结论…OO OOOO0……………36 参考文献……………………………………………O 综述肠道菌群的定植模式与远期过敏性疾病的发生风险……………39 致谢············································································…··”·47 个人简历……………………………………………：……………………”48 万方数据 中文摘要 婴儿生后粪便微生物区系的演变 摘 要 目的：肠道微生物在营养代谢、免疫系统成熟以及促进肠粘膜屏障 的完善中起重要作用，肠道微生物群多样性或结构的改变与多种疾病有 关，婴儿时期是肠道微生物群定植、演替的重要阶段，婴儿时期肠道微 生物群定植模式可持续至成年。以往对于肠道微生态的研究多采用培养 或分子生物学技术，对于肠道微生物群的多样性研究有明显的局限性， 随着第二代高通量测序技术的出现，以其测序快、准确度高等特点逐渐 应用于肠道微生物的研究，这些研究大多在欧美国家完成，中国此方面 文献报道不多，且样本量少，结果差异性较大，不能全面体现婴儿肠道 微生物区系的定植及演变全过程。本研究旨在通过Illumina Miseq高通量 测序平台对婴儿多个时间段的粪便微生物群进行DNA测序，探讨婴儿生 后粪便微生物区系的定植和演变过程，为今后肠道微生物群系变化与远 期疾病的发生风险提供理论依据。 方法：选择2013年11月．2015年3月在河北医科大学第三医院和石 家庄市第四人民医院出生的符合入组标准的新生儿30例，均为阴道分娩、 母乳喂养、家中成员无过敏史，母亲围产期未应用抗生素，婴儿及其双 亲均生活在石家庄市或其周边县市，气候环境，居住环境，饮食环境等 相当。收集其婴儿出生后第l、3、7天，第1个月、3个月和第6个月龄 时的粪便标本(分别设定为A．F组)，冻存于．80℃冰箱，并随访入组婴儿 上述时间段的喂养状况、健康情况及用药情况(抗生素及益生菌制剂)。 采用OMEGA E．Z．N．A试剂盒提取粪便标本中DNA，通过Illumina Miseq PE250高通量测序平台对细菌16SrRNA的V3．V4可变区域进行测序， 应用Mothur软件对测得序列进行OTU聚类，分析肠道菌群的丰度及多 样性，在门及属水平对婴儿生后肠道微生物区系进行详细描述，并结合