GenomeBrowser搭建libmysqlclient.docVIP

Genome Browser 搭建 libmysqlclient.a的解决 搭建Genome Browser的时候，需要MYSQLLIBS的环境变量，而这个环境变量需要libmysqlclient.a这个静态 函数库，但是，openSUSE的服务器上安装了MySQL 5.1,当时是用RPM装的，没有找到libmysqlclient.a这个库 没有办法，只好卸载掉了，编译安装。 卸载如下 shellrpm -e --allmatches --nodeps pack 这是单条指令卸载，当然可以做一个批处理的.sh文件 比如 shellrpm -qa | grep mysql a 这样 文件a 中就保存有关于mysql的所有安装rpm包 比如 A B C 这样的格式 这时候，用vim a 打开该文件 使用：%s/^/rpm -e --nodeps --allmatches /g 就会在每行头部加上rpm -e --nodeps --allmatches 即文件变为如下： rpm -e --nodeps --allmatches A rpm -e --nodeps --allmatches B rpm -e --nodeps --allmatches C ：w a.sh 则有a.sh shellchmod +x a.sh shell./a.sh 就可以批量卸载所有的包。 卸载之后，重新安装mysql5.1 到下载MySQL 5.1的源码文件 .tar.gz 解压之后， shell./configure --prefix=/home/bin --exec-prefix=/home/bin2 --datadir=/home/data shellmake shellmake install 安装之后，到/home/bin2/lib/mysql下发现存在libmysqlclient.a shellgroupadd mysql shelluseradd -r -g mysql mysql 然后到/home/bin2/bin下，有 shell./mysql_install_db --user=mysql 配置了用户，将mysql 设为服务开机自启动 /home/data/mysql/下有mysql.server文件 shellcp mysql.server /etc/init.d/mysql  然后就可以 shellservice mysql start|stop|restart 了，最后设置密码 /home/bin2/bin/mysql下 shell./mysqladmin -u root password noncode 然后将/home/bin2/bin加入PATH下，即 shellecho home/bin2/bin ~/.bashrc 最后，由于有些程序需要libmysqlclient.so的动态链接库，将/home/bin2/lib/mysql加入/etc/ld.so.conf shellecho /home/bin2/lib/mysql /etc/ld.so.conf shellldconfig