dna纳米结构自装配的语言能力分析 language capability analysis of dna nanostructures self-assembly.pdfVIP

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2017-09-14 发布于上海
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dna纳米结构自装配的语言能力分析 language capability analysis of dna nanostructures self-assembly.pdf

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dna纳米结构自装配的语言能力分析 language capability analysis of dna nanostructures self-assembly

第31卷第12期计算机学报 voL31No．12 2008年1z月 CHINESE COMPUTERS JOURNAL0F Dee．2008 DNA纳米结构自装配的语言能力分析陈燕傅岩孙朱萌∞ ”(北京工业大学应用数理学院北京100124) ”(弗吉尼亚理工学院基因、生物信息学和计算生物学实验室布莱克斯堡VA24061美国) 3’(克莱姆森大学计算学院克莱姆森SC29634美国) 摘要文中研究了DNA分子杂交的内在计算能力．一方面，文中基于Winfree先前关于线性分子自装配仅能产生正则语言工作的基础上，进一步扩展证明了线性自装配通过杂交分别表示左，右线性派生的线性分子，也能产生线性语言．另一方面，文中定义了一种新的通过上下文无关语言通过自装配产生线性语言的方法．即证明了等价于上下文无关语言的特定序列集能通过1一，2一，3一粘头分子的混合自装配产生线性语言，同时，这是对Winfree关于树状纳米结构自装配等价于上下文无关语言理论的一个较好的补充。关键词自装配；语言能力；粘头；分子中围法分类号TP301 ofDNANanostructure’S LanguageCapabilityAnalysis Self-Assembly CHEN Yan”FUYan2’ZHU Men93’ Science ”(AppliedCollege．BeijingUniversityofTechnology．Beijing100124) ”(Genetics，Bioinformatics，andComputationalBiology，Virginia 24061．USA) Tech，Blacksburg，VA ”(School 29634，USA) ofComputing，ClemsonUniversity，Clemson，SC AbstractThe inherentinthe ofDNAmoleculesWere computationalcapabilities hybridization examined．First，basedontheWinfree’S workwhichdemonstratedthe of previous self-assembly linearmoleculescould was that thelinear generateonlyregularlanguage，itproven self-assembly canalso linear thelinearmoleculeswhich generatelanguages，byhybridizing respectivelyrepre— senttheleft