微生物分类与鉴定-工业微生物学PDF课件-10-共11讲.pdf

第十章 第十章 微生物分类与鉴定 本章内容 一、分类单元 二、命名规则 三、分类鉴定方法 四、微生物的分类系统 据保守估计，地球上 真菌约150万种，细菌4万种，病毒130万种 但认识的微生物仅是估计数量的5~ 10%，即15万~20万种 要认识、研究和利用类群庞大的微生物资源， 必须对它们进行分类。 分类学的具体任务有三个： 分类、 命名、 鉴定 分类(classification)：根据一定的原则(表型特征相似性或系 统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关 性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便 查考和对未被分类的微生物进行鉴定。 (根据现有数据建立系统的过程) 命名(nomenclature)：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有 的名称。 鉴定(identification或determination)：借助于现有的微生物分类 系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类 地位的微生物所应归属分类群的过程。 (根据现有系统确定未知微生物分类归属的过程) 一、分类单元 1. 种以上的系统分类单元 七级 界 门 纲 目 科 属 种 （基本分类单元） 根据Carl Woese的理论，现在还在界之上使用域(domain)，即： 古生菌域、细菌域、真核生物域。 图10-5 生命世界的系统发育树状图（Olsen Woese 1993 ） 2. 种（species ） 种是生物分类中基本的分类单元和分类等级。 微生物的种：指具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群 与其他类群的菌株有很明显的区别。 由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准， 为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱， 细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念” 种和亚种指定模式菌株（type strain ）； 如：大量的豌豆根瘤菌(Rhizobium leguminosarum)菌 株中，只有菌株USDA2370才是模式菌株。 亚属和属指定模式种（type species ）； 属以上至目级分类单元指定模式属（type genus ）. 3.种以下的分类单元 1）亚种(subspecies)和变种(variety)：种内的不同菌株存在少 数明显而稳定遗传的变异特征，这种差异又不足以区分成新 种时，可以细分成亚种或变种。 2 ）型(form或type) ：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种 不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细 分为不同的型。 例如：抗原特征的差异，分为不同的血清型； 对噬菌体裂解反应的不同，分为不同的噬菌体型 3 ）菌株(strain)：从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养 物都可以称为一个菌株；用实验方法(如通过诱变)所获得 的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌株，以便与 原来的菌株相区别。 菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体 菌株与型的区别： • 菌株之间不存在鉴别特征的差异，命名不同的菌株无需分类学依 据； • 不同型的细菌之间存在鉴别特征的差异，命名或鉴定不同的型必 需有分类学依据。 4 ）培养物：一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物， 如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物。 5 ）群：一个物种转变成另一个新物种，必然要经过一系列 的过度类型，因此在两个不同种微生物之间常出现一些介于 两个菌种之间的中间过度类群。通常将这两种微生物和介于 它们之间的微生物类群称为群。如大肠菌