云南省登革病毒血清型和基因型多样性及溯源研究.pdfVIP

．论著 云南省登革病毒血清型和基因型多样性及 溯源研究 冯云 张海林 潘虹 范建华 刘永华 李鸿斌 尹小雄 朱进 李华昌 黄瑛 671000大理，云南省地方病防治所云南省自然疫源性疾病防控技术重点实验室(冯 云、张海林、潘虹)；666100景洪，西双版纳州疾病预防控制中心(范建华、李鸿斌、朱 I临沧市疾病预防控制 进)；678600瑞丽市疾病预防控制中心(刘永华、尹小雄)：677000 中心(李华昌)；650041昆明市第三人民医院(黄瑛) 通信作者：张海林，Email：zhangHL715@163．COIll DOI：10．3760／ema．j．issn．1003—9279．2017．叭．005 【摘要】 virus，DENV)流行株的血清型、基因 目的阐明2013—2015年云南省登革病毒(Dengue 型及传播来源。方法从云南省登革热患者急性期血清中提取病毒核酸。通过RT—PCR扩增DENV 包膜蛋白(Envelopeprotein，E)基因序列，采用ClustalX、DNAStar和MEGA5生物信息学软件进行核 苷酸和推导氨基酸序列同源性分析及系统进化分析。结果经RT—PCR和序列测定获得了2013—2015 年云南省40株DENV的E基因序列，系统进化和同源性分析表明．15株属于DENV血清型1型 (DENV一1)，其中14株(瑞丽市11株，临沧市1株，昆明市2株)为基因I型(Genotype—I，G—I)，1株 (昆明)为G—V；22株属DENV血清型2型(DENV一2)，其中瑞丽市10株为G—I，西双版纳12株为G— IV；2株(西双版纳)属DENV血清型3型(DENV一3)的G—II；1株(瑞丽市)属DENV血清型4型 (DENV-4)的G—I，这些基因型均是东南亚地区的优势基因型。所有云南株DENV均与缅甸、老挝和 泰国等东南亚流行株具有较高的同源性和较近的亲缘关系。结论2013—2015年云南省存在DENV 四种血清型及其多种基因型的流行。云南省登革热的传播来源主要为相邻的东南亚国家。应加强 云南省边境地区输入性病例的监测和管理。 【主题词】登革病毒；E基因；血清型；基因型；系统进化分析 基金项目：国家自然科学基金一云南省联合基金(U1036601) of and andmolecularof virusesisolatedfrom Diversityserotypesgenotypes tracingdengue dengue fevercasesinYunnan Hailin，Pan FengYun，Zhang Hong，FanJianhua，LiuYonghua，LiHongbin， Yin Jin，Li Xiaoxiong，ZhuHuachang，HuangYing YunnanInstituteEndemicDiseaseControland for Prevention．YunnanProvincial Zoonosis KerLaboratory南r Contr02and Prevention，Dali HL，Pan Pre居cture 671000，呖ina(FengY，Zhang H)；Xishuangbanna DiseaseControland Center Centerfor 666100，China(FanJH，LiliB，Zhu Prevention，Jinghong J)；Ruili DiseaseContr02and Pr