多发性肌炎骨骼肌组织差异基因表达谱分析.pdfVIP

空生凰望痘堂盘查垫!!至2旦箜21鲞箜2麴gh地』丛!坠坐坠尘!里￡垒堡掣垫12：yQ!：21：盟Q：2 ·99· ·基础研究· 多发性肌炎骨骼肌组织差异基因表达谱分析 彭清林张亚妹杨阚波 张学智 卢昕王国春 【摘要】 目的筛查PM患者骨骼肌组织中差异表达基因。方法2015年1月至4月获取于中日 友好医院风湿免疫科的5例未经治疗PM患者骨骼肌组织、5例无肌肉病变的创伤患者的对照骨骼肌组 织样本，提取组织总RNA，采用基因芯片进行基因表达谱分析。差异表达基因进行基因本体论分析和信号 通路分析。采用实时定量PCR方法对芯片筛查的差异基因进行验证。组间比较用t检验，芯片数据分析中 。 mini 1905 787 的多重比较采用Bena Hoehbe法校正。结果基因芯片共筛选出 i．中其rg ，因基达表异差个 个为上调基因，1 118个为下调基因(差异倍数2，P0．05)。选择其中3个上调基因和3个下调基因进行 实时定量PCR验证，结果证实其表达趋势与基因芯片检测结果一致。基因本体论分析和信号通路分析结 果显示这些差异基因主要涉及感染、细胞毒作用等生物学过程，且与其他自身免疫病有部分共同的信号 通路失调。结论PM患者骨骼肌组织与健康人相比存在基因表达差异，PM肌肉病变的发生可能是多基 因参与、多基因调控导致。 【关键词】多肌炎；基因表达；芯片分析技术 基金项目：国家自然科学基金81571603)；中日友好医院院级课题青年项目(2014—3一QN一 25)，首都卫生发展科研专项项目(2016—2—4063) identifiedinthemuscleof with bymicroarray Differentiallyexpressedgenes patientspolymyositis Xuezhi，Lu analysisPe增Qinglin，ZhangYamei，YangHanbo，Zhang Xin,WangGuochun．Departmentof and 100029，China Rheumatologyhnmunology,China—JapanFriendshipHospital,Beijing Guochun，Emaih Correspondingauthor：Wang guochunwang@hotmail．com To the inthemuscleof 【Abstract】objectiveprofiledifferentiallyexpressedgenes polymyositis(PM) AmRNA was to mRNAsfrom5 treatment—naivePM patients．Methodsmicroarrayanalysisperformedprofile and5 controls．GeneandKEGG were todelineatethe patients healthy Ontology pathwayanalysesapplied functionalrolesofthe real．timePCR wasconductedto difierentiallyexpressedmRNAs．Quantitativeanalysis validatethe data．TheStudent7S t-testwasusedto thestatistical ofthe m