广州市2001-2015年登革病毒2型E基因进化分析.pdfVIP

·90· J 中华流行病学杂志2017年1月第38卷第1期Chin 2017，V01．38，No．1 Epidemiol，January ·实验室研究· 1--201 广州市200 5年登革病毒2型 E基因进化分析 刘远 蒋力云 罗雷 曹毅敏景钦隆杨智聪 510440广州市疾病预防控制中心消毒杀虫部(刘远、罗雷)，病毒免疫部(蒋力云、曹 毅敏)，传染病预防控制部(景钦隆、杨智聪) 通信作者：杨智聪，Email：yangzc@gzcdc．org．cn DOI：10．3760／cma．j．issn．0254—6450．2017．01．018 【摘要】 目的了解2001--2015年广州市登革病毒2型(DENV2)的流行情况；通过对分离 DENV2 E基因的进化树和分子钟分析，掌握毒株的进化情况和趋势。方法将登革热确诊病例 的血清用荧光PCR进行检测，DENV阳性血清用C6／36细胞进行病毒分离，测定分离毒株的E基 4．0软件构建进化树，采用BEASTvl．8．2绘制分子进化钟。结果2001— 因序列，利用Mega 2015年共分离到26株DENV2，从基因型上分类属于全球型和亚洲1型，并与东南亚地区分离到的 毒株相似率较高；BEASTvl．8．2计算出广州市DENV2全球型在46年前和35年前进一步出现亚型 的分化，广州市DENV2的平均变异率为每年每位点7．1×10。。结论广州市DENV2与东南亚地 区的毒株有较高同源性和进化上的联系，广州市DENV的输入压力较大，存在重症登革热暴发的 潜在风险。流行于广州市的全球型DENV2可能存在2个不同输入来源，广州市DENV2的变异率 与周边地区基本持平。 【关键词】登革病毒；E基因；分子进化 基金项目：广东省自然科学基金($2013010013637)；广州重点学科建设项目(2013—2015—07) of of virus 2in PhylogeneticanalysisenvelopegenedengueserotypeGuangzhou，2001-2015 Liu Lei，Cao Yuan，JiangLiyun，Luo Yimin,JingQinlong,玩ngZhicong Y，LuoL)，VirusDepartment(JiangLY,Cao DisinfectionDepartment{Liu YM)，EpidemiologyDepartment DiseaseControland 510440,China (JtngQL,Y0ngZC)，GuangzhouCenterfor Prevention,Guangzhou Correspondingauthor：№昭Zhicong,Email：yangzc@gzcdc．org．cn To themolecularcharacteristicsof virus 【Abstract】Objectiveinvestigate dengueserotype 2 theE ofthestrains fDENV2)inGuangzhouduring2001—2015，andanalyze gene isolated，the andmolecularclockwereconstructedtoknowabouttheevolutionofthestrains． tree phylogenetic MethodsTheserum ofthe weredetectedrealtimePCR．and