四川省首株盖塔病毒SC1210的鉴定.pdfVIP

．论著． 12 四川省首株盖塔病毒SC10的鉴定 李伟 潘明 周兴余 林世华 刘学成 付士红 陈丹林 曹一欧 梁国栋 张佳珂 610041成都，四川省疾病预防控制中心(李伟、潘明、周兴余、林世华、刘学成、陈丹林、 曹一欧、张佳珂)；102206北京，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所(付士红、梁 国栋1 李伟、潘明为并列第一作者 通信作者：张佳珂，Email：scszjk@163．COIll DOI：10．3760／cma．i．issn．1003—9279．2017．01．001 【摘要】 目的对四川省从蚊虫分离到的病毒SCl210进行鉴定并分析其基因组特征。方法 Torrent 利用披膜病毒科甲病毒属特异性引物进行RT—PCR鉴定，并采用二代测序平台IonPGM进行 基因组全序列测定，然后利用MegaAlign软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析，利 6软件绘制系统发生树。结果SCl210为盖塔病毒(Getahvirus，GETV)，该株病毒基因组全 用Mega 长11690nt，与国内外其他分离株的核苷酸同源性为99．2％一99．7％，氨基酸同源性为96．5％一 99．4％。衣壳蛋白全长为804nt，编码268个氨基酸，与其他株的核苷酸同源性为94．9％一99．2％，氨 266 基酸同源性97％一99．6％。E2基因全长lnt，编码422个氨基酸，与其他株的核苷酸同源性为 94．6％-99．6．氨基酸同源性为97．1％一99．5％。3’UTR全长402nt．具有GETV病毒独特的3个完整 的重复序列元件和19nt的保守序列。结论 四川省分离到的首株GETVSCl210与云南分离株 YN0540亲缘关系较近，而与马来西亚原始株MM2021亲缘关系较远。 【主题词】 盖塔病毒；衣壳蛋白基因；E2蛋白基因；3’非翻译区；核苷酸序列 FirstisolationandidentificationofGetahvirusSCl210inSichuanLiWei．凡nMing．觋OUXingyu， Lin flake Shihua，Liu Danlin，Cao Xuecheng，几Shihong，ChenYiou，LiangGuodong，Zhang and SichuanCenterforDiseaseControl 610041，饥ina(LiW，PnnM，ZhouXY．Lin Prevention，Chengdu InstituteViraZDiseaseContr02and SH，LiuXC，Ch肌DL，Cao JK)；Nationaffor Prevention， YO，Zhang Chinese DiseaseControland 102206，China(FuGD) Centerfor Prevention，Beijing SH，Liang 厶耽iandPan arethe authorswhocontributedtothearticle mink tint equally Correspondingauthor：Zhangflake，Email：scszjk@163．COIn To the molecularcharacteristicsofGetah 【Abstract】Objectivestudy genome virus(SCl210) whichisolatedinSichuan