21世纪的计算生物学可扩展压缩算法.PDFVIP

译文 第 12 卷  第10 期  2016 年 10 月 21世纪的计算生物学：可扩展 压缩算法* 作者：伯妮·伯杰(Bonnie Berger) 　　　诺亚·M·丹尼尔斯(Noah M. Daniels) 　　　Y·威廉·于(Y. William Yu) 关键词 ： 计算生物学 译者：崔英博　李文涛　杨顺云　等 利用海量生物数据内在结构的算法研究新进展。 计算生物学家回答生物及生物医药问题时，会 在实验阶段利用计算技术以获得更加准确的结果并 基因数据 计算能力 降低开销。在过去的20 多年间，出现了很多史无前 ， 对 ， 例的技术进展，并产生了大量的生物数据(biological 力 S 据 基 能 P 数 碱 O 千 data) ，如下一代基因测序技术、质谱法、基因芯片、 算 L 因 F 基 日 计 T 每 冷冻电镜以及其他导致数据爆炸的高通量方法。然 而，这一数据爆炸也带来了两个方面的问题 ：一方 面，数据的规模和范围可以帮助我们更好地了解基 年 (a) 因、传染病、癌症、基础生物学甚至人类的基因迁移； 另一方面，研究者产生了如此巨大的数据集，在这 些数据集面前，人们难以找到有效的分析方法来发 ， ， 对 量 据 基