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棉花品种基因纯度和特异性的SSR标记分析-中国农学通报
中国农学通报 2011,27(30):49-54
Chinese Agricultural Science Bulletin
棉花品种基因纯度和特异性的SSR 标记分析
1 2 2 1 1
刘国栋 ,钟 文 ,曲辉英 ,王芙蓉 ,张 军
1 2
(国家棉花改良中心山东分中心/ 山东棉花研究中心,济南250100 ;山东省种子管理总站,济南250100 )
摘 要:为从分子水平上鉴定棉花品种的纯度和真实性,采用扩增带型清晰,多态性较高的SSR 引物对
51 个常规棉品种进行了基因纯度鉴定、遗传聚类分析和品种特异性鉴定。基因纯度鉴定结果显示,69%
的品种基因纯度较好,基因纯度在90% 以上;12%的品种基因纯度较差,基因纯度在80% 以下。聚类分
析结果表明,所有品种分为2 个大类和4 个亚类,这反映出品种间的遗传基础较窄。品种特异性鉴定中,
以遗传距离阈值T=0.01 为划分标准,83%的品种具有特异性。这说明利用SSR 标记可以有效鉴定棉花
品种的基因纯度和特异性。
关键词:棉花;SSR;基因纯度;聚类分析;特异性
中图分类号:S562.035.3 文献标志码:A 论文编号:2011-1801
Analysis on Gene Purity and Specificity of Cotton (Gossypium hirsumtum L.)
Varieties by SSR Marker
1 2 2 1 1
Liu Guodong , Zhong Wen , Qu Huiying , Wang Furong , Zhang Jun
1
( Shandong Branch of National Cotton Genetic Improvement Center/
Cotton Research Center of Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan 250100;
2Shandong Seed Administration Station, Jinan 250100)
Abstract: In order to identify cotton variety and test seed purity at the molecular level, gene purity and variety
specificity of 51 cotton (G. hirsumtum L.) varieties were characterized by SSR primer pairs with high
polymorphisms and stable amplified bands. The results showed that: most (69%) of the tested varieties with
gene purity greater than 90% , while 12% of them with gene purity less than 80% . Genetic clust
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