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第一章 基因组和染色体 基因组 （genome） 在一套染色体中遗传物质的总和。 基因组学（genomics） McKusick,V.将定义为从整个基因组的视角来研究遗传学的科学。 结构基因组学 (structuralgenomics) ：结构基因组学是研究基因组的物理特点，即基因组作图。结构基因组学实际上是为功能基因组学做准备，一旦功能基因组学进入实质性的发展阶段，人类将可以从中获得更大的利益。 功能基因组学（functional genomics） ：功能基因组的任务是进行基因组功能注释（Genome annotation），了解基因的功能，认识基因与疾病的关系，掌握基因的产物及其在生命活动中的作用。 进化基因组学：通过比较不同物种的基因组来研究沿着进化的路线在基因组结构中所发生的改变。 原核基因组常为双链环状DNA，以类核形式存在。真核基因组以线状DNA，以染色体形式存在。 原核基因组含有大量单一顺序（unique-sequences），仅有少量的重复顺序。 真核基因组含少量单一顺序和大量重复顺序。 原核生物的细胞中除了主染色体以外，还含有各种质粒和转座因子。 真核生物除了核染色体以外，还存在细胞器DNA。? 第一节???原核生物基因组的结构特点 E.coli 2.4×109 Da， 4639 Kb（1300微米），闭合环状，约编码 4,288 个基因。 类核（nucleoid）。 支架 (scafford） 100个DNA环组成，每个环长40Kb，13微米。每200bp就有一个负超螺旋（?=0.05）,即基因组中含5%的负超螺旋。 超螺旋以两种状态存在： （1）自由状态的超螺旋，可在环内传递张力。 （2）超螺旋受到束缚，不能传递张力。 一．类核的结构 二 重叠基因(overlapping gene) 莲人在绿杨津 采 一 玉漱声歌新阙 采莲人在绿杨津，在绿杨津一阙新； 一阙新歌声漱玉，歌声漱玉采莲人。 1976年Burrell B. G., Air G. M. 和 Hutchison C. A.首先报告ФX174噬菌体含有重叠基因。 1977年Sanger证实了重叠基因 他对单链环状的噬菌体?X174进行了测序。 5386nt 11 基因， 3个转录单位，由3个启动子（pA，pB，pD）启动。 ?X174含有的5386nt最多能编码1795个氨基酸，若每个氨基酸的平均分子量为110Da，则总的蛋白质分子量为197,000Da，但实际蛋白质总分子量却为262,000D。 将全部DNA顺序和蛋白质的氨基酸顺序进行比较，发现了重叠基因。 nested genes 重叠基因 位于基因中的基因，即通过选择不同的翻译终止点而产生两种或更多种嵌套蛋白产物的单个基因。产生的机制可能是通过终止密码子的不完全终止（例如Qβ病毒的衣壳蛋白的表达），或者翻译时发生移码(如在大肠杆菌danX基因和F质粒的traX 基因 )。真核细胞的RNA病毒也采用类似策略。真核基因也可通过选择性剪接或采用选择性加尾产生嵌套产物。 三．质粒(plasmid) 1．抗性质粒（Resistance （R）plasmids）: 2.? 致育因子（Fertility （F）plasmids） 3.??Col质粒：有编码大肠杆菌素（colicins）基因。 4.?? 降解质粒(degradative plasmids)。这种质粒编 码一种特殊蛋白，可使宿主菌代谢特殊的分子， 如甲苯或水杨酸。 5.?侵入性质粒(virulence plasmids)。这些质。如Ti 质粒，此是在根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)中发现的 第二节 真核基因组的复杂性 分子量约为3×1012道尔顿 长度为2×106Kb， 形态为线状， 约编码3万个以下的基因。 人类细胞在二倍体的核中DNA长约30亿个碱基对 估计编码2~2.5万个基因， 每条染色体含碱基8千万至3亿不等。 现已有5千个基因被编目，1900个基因已进行了染色体定位，600个已被克隆分离出来。 若将一个细胞中每条染色体的DNA首尾彼此相接，全长约200cm。 1986年 Renato Dulbecco于首先提出了“人类基因组计划（HGP）” 1989年由美国能源部和美国国家卫生研究院(NIH)联合提出一项生命科学研究项目。于1990年1月开始。预计2003年6月完成。 1999 破译出人类第22号染色体的遗传密码。 2000 完成了人类第21号染色体的测序。 2000年