主成份分析 principal component analysis (pca).pptVIP

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2018-02-17 发布于天津
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主成份分析 principal component analysis (pca).ppt

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主成份分析 principal component analysis (pca)

主成份分析Principal Component Analysis (PCA)生物資訊室 Bioinformatic CoreResearch Assistant 葉坤海主成份分析的特性代表性保有原來變數的資訊獨立性新的變數不能重疊精簡性用”少數”代替原來的”多個”變數收集20位學生身高、體重，如下 No. X1 X2 1 183 75 2 178 70 3 175 68 4 172 60 5 170 72 6 169 65 7 166 54 8 164 58 9 161 49 10 163 58 11 162 60 12 162 54 13 162 51 14 160 56 15 158 52 16 156 46 17 153 45 18 149 44 19 152 43 20 150 45 資料點的投影方向主成份的幾何意義 No. x1 x2 1 183 75 2 178 70 3 175 68 4 172 60 5 170 72 6 169 65 7 166 54 8 164 58 9 161 49 10 163 58 11 162 60 12 162 54 13 162 51 14 160 56 15 158 52 16 156 46 17 153 45 18 149 44 19 152 43 20 150 45 y1 y2 179.922 82.29 172.852 82.06 169.34 81.238 161.448 84.52 168.84 74.852 163.046 78.91 152.964 84.244 154.516 80.048 145.894 84.014 153.832 79.318 154.608 77.22 150.228 81.324 148.038 83.376 150.32 78.496 146.032 79.772 140.284 82.416 137.502 80.91 134.036 78.674 135.358 81.548 135.45 78.72 總變異第一主成份解釋的變異比例第二主成份解釋的變異比例 No. X1 X2 1 183 75 2 178 70 3 175 68 4 172 60 5 170 72 6 169 65 7 166 54 8 164 58 9 161 49 10 163 58 11 162 60 12 162 54 13 162 51 14 160 56 15 158 52 16 156 46 17 153 45 18 149 44 19 152 43 20 150 45 standardize 2.139 1.910 1.597 1.401 1.272 1.197 0.947 0.382 0.731 1.604 0.622 0.891 0.297 -0.229 0.081 0.178 -0.243 -0.738 -0.027 0.178 -0.135 0.382 -0.135 -0.229 -0.135 -0.534 -0.351 -0.025 -0.568 -0.433 -0.785 -1.044 -1.110 -1.146 -1.543 -1.248 -1.218 -1.350 -1.435 -1.146 PC1 PC2 2.857 0.254 2.115 0.207 1.744 0.110 0.927 0.430 1.671 -0.564 1.076 -0.155 0.036 0.374 0.185 -0.062 -0.705 0.327 0.111 -0.141 0.186 -0.360 -0.259 0.058 -0.483 0.267 -0.259 -0.239 -0.705 -0.118 -1.299 0.141 -1.596 -0.026 -1.966 -0.272 -1.819 0.034 -1.818 -0.263 主成份score 主成份散佈圖身高體重數學國文英文 No. x1 x2 x3 x4 x5 1 183 75 85 62 93 2 178 70 64 96 73 3 175 68 93 79 76 4 172 60 60 84 62 5 170 72 79 88 79 6 169 65 80 84 69 7 166 54 71 75 72 8 164 58 79 81 67 9 161 49 90 102 63