课件6代谢组学.ppt

代谢组学（Metabonomics）及其应用 王玮 三羧酸循环 代谢组学的创建 普遍认为代谢组学的概念是英国帝国理工大学的Nicholson教授于1999年首先提出来的。 Nicholson因为他在代谢组学发展上的开拓性贡献，被学术界公认为代谢组学创始人（代谢组学之父）。 Nicholson JK, Lindon JC, Holmes E (November 1999). "'Metabonomics': understanding the metabolic responses of living systems to pathophysiological stimuli via multivariate statistical analysis of biological NMR spectroscopic data". Xenobiotica 29 (11): 1181–9 代谢组学的定义 Metabonomics，国内翻译成代谢组学。对生物系统进行的整体和动态的认识，主要将核磁共振技术应用于健康与疾病研究，多以来自动物的样品为研究对象。 Metabolomics，国内翻译成代谢物组学。强调分析而且是静态的认识概念，主要应用色质联用等分析技术，多用于植物和微生物领域的研究。 代谢组学的定义 中科院大连化学物理研究所的许国旺研究员认为上述两者的研究对象都是代谢物，并没有本质区别，它们都可称为代谢组学。 代谢组学定义 代谢组是指一个细胞、组织或器官中所有代谢物的集合, 包含一系列不同化学型的分子, 比如肽、碳水化合物、脂类、核酸以及异源物质的催化产物等。代谢组学来源于代谢组一词,是研究一个细胞、组织或器官中所有小分子代谢组分集合的科学。 代谢组（metabolome）：基因组的下游产物也是最终产物，是一些参与生物体新陈代谢、维持生物体正常生长功能 和生长发育的小分子化合物的集合，主要是相对分子量小于1000的内源性小分子。 代谢物数量因物种不同而差异较大： 植物（200 000种）、动物（2500种）、微生物（1500种） The metabolome consists of what? Small organic molecules: amino acids, fatty acids, carbohydrates, vitamins, and lipids & some inorganic, elemental species Metabolome informatics resource: Kyoto Encyclopedia of genes and genomes (kegg) http://www.genome.jp/kegg/compound The human metabolome project: metabolomics toolbox http://www.metabolomics.ca National Centre for Plants & Microbial Metabolomics: http://www.metabolomics.bbsrc.ac.uk Size of metabolomes varies greatly Saccharomyces cereviciae ~ 600 metabolites (compared to over ~6,000 genes) Plants: ~ 200,000 primary & secondary metabolites Human metabolome: Much larger Degree of diversity encompasses: Molecular weights (wide range of mwt) Polar (carbohydrates) Non-polar (terpenoids & lipids) Volatile vs. non-volatile organic compounds 代谢组学（Metabonomics/ Metabolomics ）：通过考察生物体系（细胞、组织 或生物体）受刺激或扰动后（如将某个特定的基因变异或环境变化后），其代谢产物的变化或其随时间的变化，来研究生物体系的一门科学。 代谢组学研究的目的是定量分析一个生物系统内所有代谢物的含量。代谢组学分析可以指示细胞、组织或器官的生化状态, 协助阐释新基因或未知功能基因的功能, 并且可以揭示生物各代谢网络间的关联性, 帮助人们更系统地认识生物体。 代谢组学定义 代谢组学的发展 代谢组学的发展（解释上图） 最早起源于代谢轮廓分析（Metabolic profiling）。早在二十世纪七十年代，Baylor药学院就已经提出并发表了代谢轮廓分析的理