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提总DNA操作步骤
STE boiling method
试剂:
STE:100mM NaCI, 10mM Tris-CI(pH 8.0), 1mM EDTA(pH 8.0)
10mg/ mL蛋白酶K
步骤:
1 细胞离心(2000rpm,10min),去上清;
2 细胞沉淀中加STE(50uL),打散细胞团、混匀,再加蛋白酶K(2uL, 10mg/ml),摇
匀。95度5min,随后37度处理30min。
3 微量离心。
Characterization of Wolbachia Host Cel lRange via the In Vitro Establishment o fInfections
步骤:
1 106细胞离心(2000rpm,10min),去上清;
2 细胞沉淀中加STE(100uL),打散细胞团、混匀,再加蛋白酶K(2uL, 20mg/ml),摇
匀。56度处理60min。
Cytological properties of an Aedes albopictus mosquito cell lineinfected with Wolbachia strain wAlbB
步骤:
1 106细胞离心(14000rpm,10min),去上清;
2 细胞沉淀中加200ul 双蒸水溶解,之后加入200ul 20 mM Tris-CI(pH 8.0),其中含有200mM NaCI,2mM EDTA,1%SDS, 10ug DNAse-free RNAse A。混匀,37度处理1小时,再加蛋白酶K(20ug),摇匀。56度处理60min。
3 样品95度处理10min ,用酚提取,再用乙醇沉淀。
4 样品重复用70%的乙醇处理,离心,重新溶于0.1ml的双蒸水。
改良CTAB 法
CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中((0.7 mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时,从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB-核酸的复合物与蛋白,多糖类物质分开。
Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;
EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;
NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中
β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除基因组DNA
CTAB 核裂解液
CTAB 4g
NaCl 16.364 g
1M Tris-HCl 20ml ( PH8.0)
0.5M EDTA 8ml,
,2%PVP(W/V)
先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml灭菌
冷却后0.2-1% 2-巯基乙醇(400ul)
氯仿-异戊醇(24:1):先加96ml氯仿,再加4ml异戊醇,摇匀即可
CTAB 核裂解液[100 mmol/L Tris-HCl(pH 8.0),50 mmol/L EDTA (pH 8.0),1.4 mol/L NaCl,2%CTAB(W/V),2%PVP(W/V)],65 水浴保温60 min。冷却几分钟后加入600 μl氯仿/异戊醇(V/V为24:1),摇匀室温放置5 min,10 000 r/min 离心10 min,重复抽提1次。取上清,加入1/5体积的5 mol/L 的NaCl,加入2/3 体积的预冷异丙醇摇匀,室温放置15 min 后可见白色丝状DNA 沉淀析出。室温离心去上清后加入70% 的乙醇清洗2 次,真空干燥后加入200 μl TE 溶解沉淀,加入RNase A 至终浓度为10 μg/ml,37 水浴保温30 min。加入等体积的氯仿/异戊醇,混匀,10 000 r/min,室温离心10 min,取上清加入1/10 体积的3 mol/L NaAc(pH 5.2),混匀后再加入2 倍体积的无水乙醇,-20 放置30 min。离心,弃上清,70%的乙醇清洗2次,室温风干后溶于50 μl的TE 中,-20 贮存备用。
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