生物大分子晶体学基础(II)2016.ppt

四方晶系体心F格子与4次轴的组合，在(1/4, 1/4,Z)出派生出42螺旋轴和在(0, 1/4,Z) 处派生出21轴。即在四方F 格子中，4与42和21派生共存。 四方晶系面心F格子与41轴的组合，在(1/4,1/4,Z)处派生出43螺旋轴和在(1/4,0,Z)处派生2次轴。即在四方F格子中，41与43以及2次轴派生共存。 四方晶系面心F格子与-4反伸轴的组合，在(1/4,1/4,Z)处派生出反伸中心在1/4高度的-4轴和在(0,1/4, Z)处派生21轴。即在四方F格子中，-4与-4以及21轴派生共存。 空间群的推导及其国际符号 晶体学微观空间对称元素及其平移群（周期平移与非初基平移）的组合结果，组成了晶体微观空间的对称类型。所有的组合结果一共有230种可能的组合，称为230个空间对称群或简称空间群。 晶体的取向（晶体学轴）与晶体的对称性密切相关，晶体学的轴（a,b,c)总是与晶体中某些对称元素的取向一致。空间群的对称元素取向与点群是一致的，即在不同的晶系中，同一点群所属的不同空间群其对称元素的取向与点群一致。 一般来说，坐标系的原点可以任意选择。但为了统一，一旦坐标轴的方向确定之后，坐标系的原点选择必须遵守如下规则： 1、如果空间群中存在对称中心，坐标系的原点应选择在对称中心上，如有多个对称中心，应选择在高对称性的对称中心上； 2、如果没有对称中心，坐标系原点应选择在高次轴上； 3、选择高次螺旋轴上； 4、选择在2次轴上； 5、选择在m面上； 6、选择在2次螺旋轴上； 7、选择在滑移面上。 空间群的国际符号 空间群的国际符号由两部分组成： 第一部分是空间群国际符号的第一个大写英文字母，它表示了该空间群的平移群即布拉维格子，如P，C（A,B），I，F。 第二部分（1-3个对称元素符号）是该空间群所具有的初始亦即最基本的对称元素，与宏观对称组合相同，表明了这些基本对称元素的方向。 三斜晶系：P [000] 单斜晶系：P [010]，C(A)[010] 正交晶系：P [100][010][100]， C(A,B) [ 100][010][100]， I [100][010][100]， F [100][010][100] 四方晶系： P [001][100][110]， I [001][100][110] 六方晶系：P(or H) [001][100][120] 三方晶系：两种点阵类型H（与六方相同）和R， P[001][100][120] 或者 R [111][110] 立方晶系： P [001][111][110]， I [001][111][110] ， F [001][111][110] 不同晶系空间群国际符号及其基本对称取向 - 从空间群的国际符号推导等效点系 一个给定的空间群国际符号，明确给出了该空间群的格子类型和组成该空间对称的基本对称元素的性质和位置及取向，我们就可以导出该空间群的全部对称元素及其分布，获得该空间群的等效点系及其等效点的坐标。 例1 空间群C2，属单斜晶系。单斜晶系只有单方向上的对称元素分布，即在平行于晶体学轴b([010])方向上有2次轴（或21轴）或垂直于该方向的对称面（滑移面）。 C格子具有1/2(a+b)周期的非初基平移，这意味着有一个等效点(X,Y,Z)，就必然有另一个等效点(1/2+X,1/2+Y,Z)， 等效点(X,Y,Z) 经2次轴对称操作的另一个等效点为(-X,Y,-Z)，等效点(1/2+X,1/2+Y,Z) 经2次轴对称操作的另一个等效点为(1/2-X,1/2+Y,-Z)。 2次轴有2个等效点，C格子有2个等效点，C2空间群共有4个等效点。 此空间群没有原点性质问题，原点就在2次轴上。 例2 该空间群为普通格子，没有非初基平移。两个21轴相交组合后在(1/4,1/4,Z)处派生出2次轴。 单斜晶系的初基P格子和侧面心C格子 单斜晶系中可存在初基格子（P）和侧面心（A或C）格子，不存在B格子。 正交晶系的格子 正交晶系中可存在初基格子（P）和侧面心格子（A,B,C)，体心格子（I）和面心格子（F)。 六方晶系只存在H格子（或P格子） 四方晶系的初基P格子和体心I格子 四方晶系中可存在初基格子（P）和体心格子（I）。 立方晶系可存在初基格子（P）、体心格子（I）和面心格子（F） 三方晶系只存在初基格子（P或R） 非初基平移与微观对称元素的组合 晶体中如果存在非初基的平移的话，这些平移将与微观对称元素进行组合。进而派生出一些新的对称元素，产生新的对称类型。 对称中心与非初基平移的组合 侧面心C格子与对称中心的组合，在(1/4,1/4,0)处派生出一个对称中心。 体心I格子与对称中