基于隐马尔科夫模型的基因识别系统设计与实现.pdfVIP

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基于隐马尔科夫模型的基因识别系统设计与实现

基于隐马尔科夫模型的基因识别系统设计与实现 刘 青 严向东 (华中科技大学计算机学院计算机应用系,武汉 %#I% ) : JK0+5 5LMNO6PQ6+.0$F3K 摘 要 随着基因组研究的发展,利用机器学习方法进行基因识别被广泛使用,这些方法包括神经网络算法、基于规则 的方法、决策树、概率推理等。文章描述了一种基于隐马尔科夫模型的基因识别系统,介绍了/ 训练算法和+P-1D+ 序 列分析算法,该系统运用 的公共数据集进行测试,核苷识别的 和 两个参数分别可以达到 和 RO16-PS7O+T3 U. UV GWX ,外显子识别的 和 参数达到 和 。 WWX U. UV GX G#X 关键词 隐马尔科夫模型 基因识别 / 算法 +P-1D+ 算法 文章编号 ( ) 文献标识码 中图分类号 !JW##J !# !%JGYJ# ) Z[W !#$% ’( )’*$+’,$- -. /# )0-%$+$% 12#,3 4’#( - 5$(( 6’78-9 6-(* :$; $% =’ $’%(-% ( , , ) UFN335 3\ ]3KVOP-1 UF+-.F- *O0^N3.T _.+4-16+P‘ 3\ UF+-.F- 0., Z-FN353T‘ aON0. %#I% : , , ?@#,7’0, )6 PN- ,-4-53VK-.P 3\ PN- 7-.3K- [13b-FP T-.- 1-F3T.+^+.T 6‘6P-K6 O6- K0.‘ K0FN+.- 5-01.+.T P-FN.+LO-6 , , , +.F5O,+.T .-O105 .-PE312 05T31+PNK6 ,‘.0K+F V13T10KK+.T 1O5-JD06-, K-PN3, ,-F+6+3. P1--6 0., V13D0D+5+6P+F 1-063.+.T$ : ZN+6 V0V-1 ,-6F1+D-6 0 V1-F+6- V13D0D+5+6P+F K-PN3, \31 K3,-5+.T 6-LO-.F-6 3\ ’() *+,,-. /01234 /3,-5$) V10FP+F05 , V13T10K D06-, 3. PN- 0D34- K3,-5 +6 ,-4-53V-, 0., 0 T33, 1-6O5P +6 0FLO+1-, D

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