真核基因的表达调控二复习课程知识讲稿.pptx

生物化学与分子生物学; 生物化学与分子生物学;真核生物基因表达的多层次复杂调控;转录水平调控;真核基因表达的染色质 水平调控; 以染色质形式组装在细胞核内的DNA所携带的遗传信息的表达首先会受到染色质结构的制约，因此，染色质水平的调控是真核基因表达调控的重要环节 ; 染色质水平调控的主要机制是对组蛋白和DNA进行修饰，通过各种修饰的组合，影响染色质的结构，从而控制特定染色质区域内的基因的表达 ;染色质水平调控; 异染色质（heterochromatin） ;二、组蛋白修饰改变染色质活性;（一）各种组蛋白均可发生特异的化学修饰;1.组蛋白修饰参与调节染色质重塑;ATP依赖的染色质重塑复合体 利用ATP水解的能量以非共价方式调节染色质结构 染色质共价修饰复合体 通过给组蛋白或DNA加上或去掉共价修饰物来调节染色质结构;组蛋白修饰常发生部位 赖氨酸、精氨酸、组氨酸等带有正电荷的碱性氨基酸残基部位;组蛋白;组蛋白;组蛋白乙酰化酶 （histone acetyltransferase, HAT） HAT: 组蛋白发生乙酰化，促使染色质结构松弛，有利于基因的转录，被称为转录辅激活因子（coactivator）;组蛋白去乙酰化酶 （histone deacetylase, HDAC） HDAC: 促进组蛋白的去乙酰化，抑制基因的转录，被称为转录辅抑制因子（corepressor）;真核DNA 分子中约有5%的胞嘧啶碱基被甲基化修饰为5-甲基胞嘧啶 胞嘧啶碱基的甲基化修饰常发生在基因上游调控序列的CpG（岛）富含区 甲基化范围、程度通常与基因表达水平呈反比;DNA分子胞嘧啶碱基的甲基化修饰是一个动态的过程 DNA甲基转移酶 （DNA methyltransferase, DNMT） 催化甲基与胞嘧啶的共价结合 去甲基化酶（demethylase） 去除5-甲基胞嘧啶上的甲基;四、非编码RNA参与调控染色质结构 ;（二）lncRNA募集染色质重塑复合体调控组蛋白修饰;;;（三）微RNA可间接影响组蛋白修饰;（四）ncRNA参与调控DNA甲基化 ;因此，当lncRNA将G9a募集到特定的染色质区域后，不仅可使该区域的组蛋白发生甲基化，也可导致该区域的DNA发生甲基化;2.miRNA可通过调控DNMT的表达而调控DNA甲基化;染色质水平调控;DNA甲基化 组蛋白去乙酰化;真核基因转录的调控;真核基因表达调控的环节很多，相对而言，转录起始是真核基因表达调控的最重要环节 参与转录调控的因素主要是顺式作用元件和转录因子，二者对转录的调控作用都包括正调控作用和负调控作用 不同元件和因子的组合可将基因的转录活性控制在不同的水平;转录调控;一、顺式作用元件是调控转录起始的DNA序列 ;顺式作用元件 （Cis-acting elements）;启动子（promoter）;;; 不含TATA盒的启动子 ;;不同基因启动子元件的组成和数量是可变的;（二）增强子能提高启动子的活性;; 作用特点 对启动子无严格专一性，同一增强子可以增强不同类型启动子的转录活性 位置不固定，可位于启动子的上游、下游或内含子中。可以远离TSS起作用;发挥作用与其序列的正反方向无关，增强子的序列颠倒后仍能起作用。 有些增强子与启动子在结构上相互连续、甚至交错而不能区分 常具有组织或细胞特异性，其活性的表现由这些细胞或组织中特异性转录激活因子来决定;;（三）沉默子可负性调控转录起始;; 作用特点 由多个功能元件构成，不同的元件和特异蛋白因子结合后协同产生复杂的阻遏模式 作用不受序列方向的影响 可远距离发挥作用;（四）绝缘子可防止基因转录受邻近区域的调控因素的影响;56;57;二、转录激活因子可激活或促进基因转录起始 ; 反式作用因子（Trans-acting factor）;2. Trans-acting factor;特异性TF 特异性识别和结合顺式作用元件，包括转录激活因子和转录抑制因子;辅助TF 自身不与DNA结合，而是通过蛋白质相互作用连接TF和基础转录装置的蛋白质，包括辅激活因子（coactivator）和辅抑制因子（corepressor）;;;; 锌指（zinc finger）模体 4个氨基酸残基与二价Zn2+之间形成配位键 指部深入DNA 双螺旋的大沟内，接触5个核苷酸;碱性亮氨酸拉链（basic leucine zipper, bZIP）模体 在C-端的氨基酸序列中，每隔6个氨基酸是一个疏水性的亮氨酸残基。当C-端形成α-螺旋结构时，肽链每旋转两周就出现一个亮氨酸残基，并且都出现在α-螺旋的同一侧。;这样两条肽链能借助疏水力形成二聚体，形同拉链一样。该二聚体的N-端是富含碱性氨基酸的区域，可借助其正电荷与DNA骨架上的磷酸基团结合;碱性