高通量测序简介-2.pptVIP

转录组研究是从整体水平研究基因功能以及基因结构。 但是，多数研究人员感兴趣的是某一特定的生物过程发育阶段或处理后的基因表达情况。基因芯片技术曾在该领域的研究中发挥了重要的作用，但它只能检测已知序列的特征，对于未知的序列无能为力。而建立在高通量测序基础上的数字化基因表达谱分析无需预先针对已知序列设计探针，即可对任何生物整体转录活动进行检测，因此应用范围更加广泛。 ③ ChIP-Seq技术及其在DNA和蛋白质相互作用研究中的应用 ChIP-Seq即染色质免疫共沉淀测序，它充分结合了ChIP和高通量测序技术的优势，能够在全基因组范围内高效地研究目的蛋白的结合位点。该技术的原理是: 首先通过ChIP技术利用抗体特异性地富集交联的目的蛋白-DNA复合体; 然后再将得到的DNA片段进行高通量测序; 最后将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白或转录因子等互作的DNA区段信息。该方法克服了以往染色质免疫共沉淀-芯片技术依赖于实验者选择探针的这一不足，可以为任何生物测序。 ④ 在基因组DNA甲基化分析中的应用 DNA甲基化在维持细胞正常功能遗传印记和胚胎发育过程中起着极其重要的作用。新一代高通量测序技术使得基因组整体水平高精度的甲基化检测成为现实。目前，已经建立了至少三种依赖于高通量测序的DNA甲基化分析技术: 甲基化DNA免疫共沉淀