肺结核患者外周γδt细胞vδ2-cdr3序列特征及其合成多肽结合抗原肽的筛选和鉴定-sequence characteristics of peripheral γ δ t cell v δ 2 - cdr 3 in pulmonary tuberculosis patients and screening and identification of its synthetic peptides binding antigen peptid.docxVIP

肺结核患者外周γδT细胞Vδ2-CDR3序列特征及其合成多肽结合抗原肽的筛选和鉴定中文摘要研究背景：许多研究已证实γδT细胞在抗结核分枝杆菌（Mycobacteriumtuberculosis,Mtb）感染免疫中发挥重要作用。人γδT细胞受体（TCRγδ）主要由Vγ9和Vδ2组成，在健康人外周血γδT细胞中约80%为Vγ9δ2T细胞，对Mtb抗原的刺激具有显著增殖反应。已发现活动性结核病（TB）患者的外周Vγ9δ2T细胞数量和对Mtb抗原刺激的增殖活性均有明显降低。但是这类Vγ9δ2T细胞亚群在抗原识别以及克隆特征方面在TB患者和健康人之间有何不同，至今了解尚不完全。鉴于TCRγδ的γ或δ链V区的互补决定簇区3（CDR3）是识别抗原表位的关键位点，而目前对于TCRγδ所识别的Mtb抗原多肽表位也不完全清楚。因此从检测和分析TB患者γδT细胞Vδ-CDR3基因谱型和序列特征，有助于理解γδT细胞在抗原识别方面的克隆特征。另外根据TB患者的优势CDR3片段序列合成的肽片段，从噬菌体多肽展示库中筛选出Mtb相关性性的抗原表位。将有助于揭示γδT细胞识别Mtb抗原表位的机制，为Mtb感染的诊断和防治提供新的方法。目的：检测和分析活动性肺TB患者外周血γδT细胞受体Vδ2链CDR3片段基因谱型和序列特征，应用Vδ2-CDR3优势片段序列合成肽在噬菌体多肽展示库中筛选Mtb抗原相关的多肽表位，并对合成的Mtb抗原多肽表位的激活人γδT细胞活性进行初步鉴定。为阐明TB患者的T细胞免疫应答机制以及免疫诊断和治疗研究提供新的科学依据。方法：1.采集肺TB患者（n=27）和健康人（n=25）外周血分离PBMC提取RNA，用RT-PCR方法扩增TCRγδ的Vδ2基因CDR3片段，PCR产物通过基因扫描分析CDR3片段长度的多样性变化。2.Vδ2-CDR3的PCR产物纯化后连接PMD18-T载体重组质粒，转化及阳性筛选后用菌落PCR法对重组阳性质粒进行鉴定，并对阳性质粒PCR产物进行基因扫描分析确定其CDR3长度；本论文研究受国家科技重大专项基金课题(2008ZX10003-011)资助3.对Vδ2-CDR3的PCR产物基因扫描优势峰对应的大部分重组质粒转化阳性克隆，以及部分非优势峰对应克隆的CDR3基因片段，测定DNA序列，并分析和比较其编码氨基酸的特征。4.从TB患者新鲜PBMC和正常人PBMC经Mtb耐热性抗原刺激增殖的T细胞扩增Vδ2-CDR3的最优势序列，合成多肽片段包被平板，加噬菌体7肽库温育后，先洗去未结合的噬菌体，然后洗脱并收获特异结合的噬菌体扩增。经3-4轮结合-淘选-扩增循环，富集特异性结合噬菌体,并经过DNA测序分析和ELISA验证阳性噬菌体，通过BLAST生物信息学分析和比对噬菌体展示多肽序列与Mtb抗原的相关性。5.从特异性富集噬菌体的多肽序列中寻找到的与Mtb相关的肽表位序列，合成7肽片段后作为抗原刺激正常人和TB患者的外周血PBMC，用流式细胞术检测γδT细胞的增殖活性。结果：1对PBMC中TCRγδ的Vδ2-CDR3片段基因扫描结果显示：TB患者组（n＝27）优势峰占总峰的比率(0.2755±0.0619)较正常人组（n=25）（0.1979±0.0346）高，TB患者组的长度变化范围为（25.11±5.52）较正常人为（19.87±3.52）高，差异均有统计学意义（p0.0和p0.0）。2TB患者TCRγδ的Vδ2-CDR3的片段数和最优势峰长度，与正常人比较无显著变化。3基因扫描分析显示CDR3转化阳性菌落PCR峰与CDR3的RT-PCR产物中的扫描峰有很好的对应关系；有意义的是最高频率菌落（占40％）的CDR3片段长度与PBMC的RT-PCR产物的基因扫描优势峰长度完全相同。4对CDR3转化的克隆（73个）的测序结果表明：TCRVδ2–CDR3序列均由两端保守的侧翼序列和中间的多变序列组成；两端保守的侧翼序列由位于N端的“CACD”和位于C端的“KLIFGKG”组成，多变的中间序列97号位均含有疏水性氨基酸残基。该其中TB患者优势取用DJ3片段。每位TB患者有自己的优势序列，患者间偶发现有共有序列。5从TB患者新鲜PBMC中Vδ2-CDR3的优势序列挑选2个，和从正常人PBMC经Mtb耐热性抗原刺激增殖的T细胞中Vδ2-CDR3序列挑选2个，合成的4条多肽片段与噬菌体七肽库经4轮淘选后，得到特异性结合的噬菌体多肽序列47条，选择其中最富集序列和有交叉序列的9条，经GenBankBLAST比对分析，发现有4条7肽序列与某些Mtb抗原的序列高度重合。6从4条与Mtb抗原相关性的噬菌体多肽序列挑选2条合成7肽片段，用于体外培养实验发现，对某些正常人和TB患者个体的γδT细胞有刺激增殖活性。结论：1.TB患者外周血γδT