冬虫夏草菌侵染钩蝠蛾昆虫幼虫相互作用转录组研究.docVIP

————————————————————————————————————————————————————— 冬虫夏草菌侵染钩蝠蛾昆虫幼虫相互作用转录组研究 中山大学博士后研究工作报告 冬虫夏草菌侵染钩蝠蛾昆虫幼虫 相互作用转录组研究 ＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｒｅｓｐｏｎｓｅｏｆＯｐｈｉｏｃｏｒｄｙｃｅｐｓｓｉｎｅｎｓｉｓｉｎｔｅｒａｃｔｅｄｗｉｔｈＴｈｉｔａｒｏｄｅｓＩａｒｖａｅ 博士后：钟欣 合作导师：张古忍教授 中山大学生命科学学院 广州?中国２０１３年１２月 中山大学博士后研究报告 目 Ｅｊ录ｊｉ２……………………………………………………………………………………………………………………………．Ｉ摘要……………………………………………………………………………………………………………………………．１Ａｂｓｔｒａｃｔ……………………………………………………………………………………………………………………………：！ 第一章引言……………………………………………………………………………………．３ １．１冬虫夏草概述……………………………．．．．……………………………………………３１．２冬虫夏草生物学研究概况………………．．．．……………………………………………４１．３转录组测序及寄生生物与宿主生物互作关系研究……………………………………．５１．４本研究的技术路线………………………………………………………………………６ 第二章冬虫夏草菌及钩蝠蛾昆虫的获取与鉴定………………………………………………８ ２．１材料与方法………………………………．．．．……………………………………………８ ２．１．１冬虫夏草菌的分离培养及鉴定…………………………………………………．８ ２．１．２钩蝠蛾昆虫的饲养及侵染………………………………………………………．８２．１．３样品ＤＮＡ提取方法与步骤……………………………………………………。９２．１．４核糖体基因序列的克隆和测序…………………………………………………．９２．１．５显微观察方法……………………………………………………………………ｌｌ ２．２结果与讨论………………………………¨¨…………………………………………．．１２ ２．２．１冬虫夏草菌的分离培养与鉴定…………………………………………………１２２．２．２健康及罹病钩蝠蛾幼虫的获得…………………………………………………１５ 第三章冬虫夏草菌与钩蝠蛾昆虫转录组测序…………………………………………………１７ ３．１材料与方法……………………………………………………………………………．．１７ ３．１．１ ３．１．２ ３．１．３ＲＮＡ提取方法…………………………………………………………………１７ＲＮＡ质量检测…………………………………………………………………１８Ｉ斟Ａ测序……………………………………………………………………………………………．１８３．１．４基因功能注释……………………………………………………………………２０３．２结果与讨论……………………………………………………………………………．．２２ ３．２．３中国被毛孢菌丝及钩蝠蛾昆虫ＲＮＡ提取结果及质量检测…………………．２２３ｔ２２测序数据质量检查………………………………………………………………２５ ３．２ ３．２３转录组拼接………………………………………………………………………３０４基因注释情况……………………………………………………………………３ｌ 第四章冬虫夏草菌侵染寄主昆虫前后转录组分析……………………………………………３７ ４．１材料与方法……………………………………………………………………………．．３７ ４．１．１冬虫夏草菌有参基因组的转录组信息分析……………………………………３７ ４．Ｉ．２钩蝠蛾昆虫无参基因组的转录组信息分析……………………………………３８４．１．３基因表达水平定量………………………………………………………………３８４．１．４差异表达分析……………………………………………………………………．３８ ４．１．５差异表达基因的ＧＯ和ＫＥＧＧ富集分析……………………………………．．３９４．２中国被毛孢侵染寄主昆虫前后有参转录组结果与讨论………………………………３９ ４．２．１ ４．２．２Ｒｅａｄｓ与参考基因组比对情况统计…………………………………………．．３９Ｒｅａｄｓ在参考基因组不同区域的分布情况……