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核酸及其多糖的提取PPT

核酸分离、纯化:多糖去除 高盐法:用乙醇沉淀时,在待沉淀溶液中加入1/2体积的5M NaCl,高盐可溶解多糖。 用多糖水解酶将多糖降解。 在提取缓冲液中加一定量的氯苯(1/2体积),氯苯可以与多糖的羟基作用,从而去除多糖 。 用PEG8000代替乙醇沉淀DNA:在500μL DNA液中加入200μl 20% PEG8000 (含1.2 M NaCl) ,冰浴20min。 多酚的去除 在抽提液中加入防止酚类氧化的试剂:β-巯基乙醇、抗坏血酸、半胱氨酸、二硫苏糖醇等 加入易与酚类结合的试剂:如PVP、PEG(聚乙二醇),它们与酚类有较强的亲和力,可防止酚类与DNA的结合 盐离子的去除:70%的乙醇洗涤 核酸沉淀、溶解 当沉淀时间有限时,用预冷的乙醇或异丙醇沉淀,沉淀会更充分 沉淀时加入1/10体积的NaAc(pH5.2,3M),有利于充分沉淀 沉淀后应用70%的乙醇洗涤,以除去盐离子等 晾干DNA,让乙醇充分挥发(不要过分干燥) 若长期储存建议使用TE缓冲液溶解 TE中的EDTA能螯和Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase pH值为8.0,可防止DNA发生酸解 RNA提取的通用方法 异硫氰酸胍/苯酚法 原理: 1.细胞在变性剂异硫氰酸胍的作用下被裂解,同时核蛋白体上的蛋白变性,核酸释放; 2.释放出来的DNA和RNA由于在特定pH下溶解度的不同而分别位于整个体系中的中间相和水相,从而得以分离; 3.有机溶剂抽提,沉淀,得到纯净RNA。 步骤: 材料准备:尽量新鲜。 裂解变性:异硫氰酸胍(亚硫氢胍,巯基乙醇,N-月桂肌氨酸等)。 使细胞及核蛋白复合物变性,释放RNA,有效抑制核酸酶。 纯化分离:苯酚,氯仿,异戊醇。苯酚/氯仿可抽提去除杂物。 洗涤:70%乙醇。 沉淀:异丙醇、无水乙醇。乙酸钠(pH4.0):维持变性的细胞裂解液的pH值,沉淀RNA。 此外还常用氯化锂选择沉淀RNA 核酸及其多糖的提取 核酸是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,因此核酸的提取是分子生物学实验技术中最重要、最基本的操作 。 第一部分:DNA提取方法简介 第二部分:DNA提取常见问题、      原因分析及其对策 第三部分:RNA提取方法简介 第四部分:RNA提取及其常见问题、 原因分析及其对策 DNA提取的基本步骤 I.材料准备 II.破碎细胞或包膜-内容物释放 III.核酸分离、纯化 IV.沉淀或吸附核酸,并去除杂质 ? V.核酸溶解在适量缓冲液或水中 基因组DNA提取:材料准备 最好使用新鲜材料,低温保存的样品材料不要反复冻融 提取血液基因组DNA时,要选择有核细胞(白细胞) 组培细胞培养时间不能过长,否则会造成DNA降解 含病毒的液体材料DNA含量较少,提取前先富集 DNA提取的几种方法 基因组DNA的提取 CTAB法 SDS法 其它 基因组DNA- CTAB法 CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,并与核酸形成复合物。 该复合物在高盐溶液中(0.7mol/L NaCl)是可溶的,通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。 注:CTAB溶液在低于15℃ 时会形成沉淀析出,因此在将其加入冰冷的 植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15℃。 CTAB提取缓冲液的经典配方 组份 Tris-HCl (pH8.0)  EDTA (pH8.0) NaCl CTAB β-巯基乙醇 终浓度 100 mM 20 mM 1.4M 2%(W/V) 0.1%(V/V)使用前加入 Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏; EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性; NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中; CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离; β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除。  CTAB法流程图 植物材料 裂解液 上层溶液 液氮研磨 抽提 细胞裂解 干燥溶解 离心洗涤 酒精沉淀 DNA溶液 基因组DNA-SDS法 SDS法原理 SDS是一种阴离子去垢剂,

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