蛋白质主链三角形拼接带的扭角计算与二级结构关系剖析.pdf

摘要 目前最流行的利用原子空间坐标判定蛋白质二级结构的方法为 DSSP(B：absch和sa】ldtn 1995)方法，它们主要通过计j々：蛋白质氢键的方法来识别蛋白质的 二级结构。本文利用蛋白质主链(：。原子的空间坐标计剪．蛋白质主 链三角形拼接带的扭角【1】，通过分析扭角与二级结构的关系，来 得到一种新的判别n螺旋和j?折叠的方法，最后比较了这种新方 法与以上两种传统方法之间的关系。 关键词；蛋白质结构分析，蛋白质主链三角形拼接带，扭角， 蛋白质二级结构，n螺旋，一折叠 ABSTRACT Th(、(、Ⅲl¨1tlv used to se(。一 lrlosi,widelytechniques assigllpro[elll strlg：turefiOlllatomic and ondaly coordinatesareDSSPKabsch by SrrRIDEFrislmmnand nl}tke Sall(1(Ⅳ(1983)and by Argos(1995)，which IISCoi Inthis aIICW h3‘dlOg(!11])Olld(_!nol’gY paper．、vcdevelopalgorithnl tbrrl_helixclll‘}t_一sheet f)llthe based oftherelation assiglllllcllt analysis 1)(!(w(、‘1lI the岫lsionatof and s‘、(一 mlglopl‘oteillbat：kbom，triangle pro[t÷ill strIIC[111、eflom oftlletorsionoJwithatOllli(： ondary colnputation angle COOIdinates the we rf、一 ofprtoteinb{tckb()11c(五Inendl compare“L(j lationbetweell an‘1 OUr twoofthe ithms： algorithm IIIOSl；,popularalgol DSSll，m(1S’I、nIDE StrllchlrO backbone Keywords：1)rolein alm]ysis}protein1_iangle、 LOIsional secondal