化学信息学绪论课件.ppt

化学信息和化学信息学 ;化学信息 化学信息可分为两大组成部分： 化学物质的化学信息：利用科学的原理和方法通过测量得到的化学成分的相关信息，如物质的物理、化学性质，物质中各成分的定性、定量以及结构信息，分子间的相互作用信息，化学反应的信息等。 媒体形式的化学信息：化学信息的记录形式，如图书、期刊、专刊、专利、数据库以及音像资料等，通过化学信息的传播使化学家们共享测量的原理、方法及测量结果。 化学信息学是近年来发展起来的新学科，它的产生与发展是基于化学信息量指数般增长，特别是组合化学及高通量筛选的迅速发展。化学信息学的产生与发展是与药物研究与开发息息相关的，但它的应用却覆盖化学学科的各个领域，如农业化学、分析化学、合成化学、物理化学等。近年来，国际上已出版与化学信息学有关的杂志，出现众多的化学信息学公司，许多大学纷纷开设化学信息学课程，培养化学信息学人才。 ;1.1 化学信息学的起源及历史 1.1.1 信息学的起源 上世纪40年代，以申农（C．E．Shannon）《通讯的数学理论》、维纳（N．Weiner）《控制论—动物和机器中的通讯与控制问题》问世为标志，信息论诞生了，它是科学发展史上的里程碑，其伟大贡献和深远影响是前所未有的。 1959年，美国宾夕法尼亚大学莫尔电子工程学院首先应用了“信息科学”的概念，这一概念既包括了信息理论又包括了信息技术。出现了：以计算机为代表的“计算机信息科学”；以文献处理自动化为代表的“图书馆信息科学”和以申农通讯信号计量理论为核心的“全信息信息科学”。三者的共同特征是：仅研究特定领域中的某些信息，对其它领域中的信息不予充分的关注与考虑。 上世纪60年代初，以申农信息论为基础的信息科学得到了一定的发展，新概念和新理论不断涌现 。;20世纪80年代以来，在申农原有信息论的基础上分别在模糊信息、概率与非概率信息、语法信息、语义信息、语用信息等方面做了大量的工作。在此基础上，人们提出了广义信息论。 1982年美国普林斯顿大学的马克卢普（F．Mchlup）在美国聚集了当时不同信息研究领域的众多学者发起了一个信息的??学科交叉的研究运动，信息理论的研究开始向其它科学领域渗透和扩展，诞生了40多种部门信息学，并发表了继申农、维纳之后的又一本经典著作《信息研究：学科之间的通讯》。 1994年，德国一批学者又发起了一个新的交叉信息科学的研究运动，开拓了部门信息学的一些新领域。虽然，研究的范围更加广泛，但是，并没有做出实质性的评论与创新性的理论。 90年代后期，部门信息学得到了蓬勃的发展，除了增加了新成员，而且，关涉到了自然科学和社会科学的众多前沿问题。其中较有影响的部门学科是：生物信息学，物理信息学，还有经济信息学，人类信息学等等。据统计目前大概已有50余种部门信息学。 ;1.1.2 化学信息学的起源与历史 ;化学界的专家学者们正试图以新的方式和方法建立化学信息周期表。 国外一些大学开设了化学信息学课程并确定为研究生的研究方向，从事研究、管理和开发化学信息的团体、机构和公司也相继出现。 美国化学会化学信息分会和图书馆协会在Indiana大学成立了化学信息教学资料交换中心（The Clearinghouse for Chemical Information Instructional Materials (CCIIM)），负责收集、发布和分发化学信息源。 美国化学会还设立了化学信息教育委员会（American Chemical Society Division of Chemical Information Education Committee）。 美国、欧洲、澳大利亚的很多大学开设了化学信息学类的课程。 在国内，化学教学指导委员会已将化学信息学列入化学教学的基本内容，北京大学化学学院已设置课程并编写了讲义，南京大学、复旦大学及我校等高校也相继开设了该课程。;1.2 化学信息学的概念及研究内容 1.2.1 化学信息学的概念 ; 化学信息学还没有统一的被广泛接受的定义及英文名称。目前最通用的为Chemoinformatics及Chemical informatics。也有用Cheminformatics， Chemi informatics。也有人把Chemical information Science及Molecular Informatics称为化学信息学。与化学信息学有关的术语有 chemi-informatics，chemometrics，computational chemistry，chemical informatics，chemical information management/science，和cheminformatics等等。 美国印第安那