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诺如病毒检测技术研究
摘 要:诺如病毒是非细菌性腹泻暴发的主要病原之一,对相关检测技术的研究十分必要。本文通过引物、探针、染料的选择,结合适用范围、灵敏度、特异性、重复性的评估对常规反转录-聚合酶链反应、荧光定量RT-PCR、反转录-环介导等温扩增、基因芯片、酶联免疫吸附测定和荧光微球检测条快速检测诺如病毒的技术进行了综述。着重关注了食品和水中诺如病毒检测的病毒富集技术,并提出平衡准确灵敏与简便高效对诺如病毒检测技术的研究具有重要意义。
关键词:诺如病毒;聚合酶链反应;荧光定量;反转录;RT-PCR;RT-LAMP
中图分类号:R373.2+5 文献标识码:A DOI:10.3969/j.issn.1006-1959.2018.02.18
文章编号:1006-1959(2018)02-0051-03
Abstract:Norovirus is one of the main pathogens in non bacterial diarrhea,research on correlation detection technology is very necessary.This paper probes,primers,dye selection,combined with the applicable scope,sensitivity,specificity,repeatability of the evaluation of conventional reverse transcription polymerase chain reaction,fluorescence quantitative reverse transcription loop mediated RT-PCR.Mediated isothermal amplification,gene chip,ELISA and fluorescent microsphere detection strip for rapid detection of norovirus technology are reviewed.Focusing on the technology of virus detection in food and water enrichment of norovirus,and put forward the balance is accurate and sensitive and efficient research on the detection of norovirus has important significance.
Key words:Norovirus;Polymerase chain reaction;Fluorescence quantitation;Reverse transcription;RT-PCR;RT-LAMP
?Z如病毒(norovirus)引起的急性肠胃炎在我国成上升趋势,尤其在学校、幼儿园、养老院等低抵抗力人群聚集地易引起集体暴发。诺如病毒传染性很强,可经粪-口传播、人传人、可经受病毒污染的水、食品等传播。据估计,由诺如病毒造成的非细菌性腹泻暴发占总数的50%~80%左右[1]。近年来,诺如病毒检测方法的相关研究快速发展,对诺如病毒的准确检测为其流行病学分析提供了依据,是有效防控该病毒的基础。
1 病毒分型
诺如病毒依据其基因RNA聚合酶和主要衣壳蛋白VP1的核苷酸序列的同源性,可分为5个基因组:GⅠ、GⅡ、GⅢ、GⅣ、GⅤ,其中易感染人的主要是GⅠ和GⅡ基因组,国内尤以 GⅡ为多。而基于VP1基因组序列的相似性以85%为界,可进一步将基因组分为不同的基因型:GⅠ-8个型,GⅡ-21个型,GⅢ-3个型,GⅣ-2个型,GⅤ-1个型[2]。
2 检测技术的研究进展
目前诺如病毒的检测技术主要有反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、荧光定量RT-PCR、反转录-环介导等温扩增(RT-LAMP)、基因芯片、酶联免疫吸附测定(ELISA)和荧光微球检测条快速检测。
2.1 常规反转录-聚合酶链反应 反转录RT技术是将RNA为模板,以反转录酶催化,用引物合成互补DNA,再经PCR采用特异性引物扩增[3],是定性检测诺如病毒的经典技术。
王作?等[4]用RT-PCR对131份腹泻儿童的粪便标准进行检测,使用两对引物:① JV12:5ATACCACTATGATGCAGATTA 3/SM31:5CGATTTCATCATCACCATA 3,扩增目标长度为432bp;②4581: 5TCTTCTCCTTCTATGGTGATGATGA3/510
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