46份菌草种质资源PEPC基因PCR―RFLP多样性分析.docVIP

46份菌草种质资源PEPC基因PCR―RFLP多样性分析 　　摘 要 根据近缘种间同源基因序列保守的原理，设计20对可用于扩增菌草PEPC基因的特异性PCR反应引物。利用PCR-RFLP技术对46份菌草种质资源进行PEPC基因多样性分析。结果表明：12对引物可对供试材料实现有效特异性扩增，PCR产物经限制性核酸内切酶Hae III酶切，在46份材料上共给出176（平均每对引物14.7）个变异类型。UPGMA聚类分析结果表明，材料间遗传相似系数（SM）在0.86～1，在遗传相似系数为0.865时，46份材料可分为四大类群，这表明PCR-RFLP技术可有效用于菌草资源的遗传多样性分析。 　　关键词 菌草 ；PCR-RFLP ；种质资源 ；PEPC 基因 ；遗传多样性 　　分类号 S567.2 　　Polymorphism Analysis of PEPC Gene Family among 　　46 Juncao Germplasms by PCR-RFLP 　　MEI Jiaming1，2） HUANG Xiaoxia1，2） WANG Yong1，2） 　　ZHU Meilan1，2） LIN Hui2） YANG Yanqing1） LU Yunhai1） 　　（1 College of Crop Science， Fujian Agriculture and Forestry University， 　　Fuzhou， Fujian 350002； 　　2 National Engineering Research Center of JUNCAO Technology， Fuzhou， Fujian 350002） 　　Abstract A total of 20 pairs of specific primers were designed to amplify the phosphoenolpyruvate carboxylase （PEPC） gene family of JUNCAO germplasms. PCR-Restriction fragment length polymorphism （PCR-RFLP） technique was applied to study the polymorphism of PEPC gene family among 46 JUNCAO germplasms. The results showed that 12 of 20 primer pairs gave good amplification patterns， and digestion of these PCR products by Hae III gave a total of 176 （14.7 per primer pair in average） different patterns among 46 JUNCAO germplasms. The genetic similarity coefficient （SM） among all accessions was ranged from 0.86 to 1. The 46 JUNCAO germplasms were clustered into 4 groups by UPGMA when genetic similarity coefficient was 0.865. The study indicated that PCR-RFLP technique could be efficiently used for analysis of genetic diversity of JUNCAO germplasms. 　　Keywords JUNCAO ； PCR-RFLP ； germplasm ； PEPC gene ； genetic polymorphism 　　菌草（JUNCAO）是指可用于栽培食用菌、药用菌培养基的草本植物[1]，它既包括芒萁、五节芒、类芦、芦竹、芦苇等野生的草本植物，也包括巨菌草、象草、紫象草、香根草、紫花苜蓿、串叶草、绿洲系列芦竹等人工栽培的草本植物，广义的菌草还包括玉米、高粱、甘蔗等作物的茎叶。随着菌草技术（运用菌草栽培食用菌、药用菌和生产菌物饲料、菌物肥料的综合技术）的不断完善和菌草产业的不断壮大，有关菌草种质资源的收集、保存、鉴定和利用工作变得越来越迫切和重要。但由于可用作菌草的植物种类繁多、来源多样，使得菌草种质资源管理存在一定的盲目性和重复性。因而从分子水平上研究菌草种质资源的遗传多样性及建立菌草种质分子鉴定技术非常重要。 　　C4植物的CO2固定效率比C3植物高很多，原