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不同花色一串红亲缘关系分析
不同花色一串红的亲缘关系分析
摘要:利用RAPD和ISSR技术,对5种花色一串红进行亲缘关系分析,基于扩增结果建立各自的遗传距离矩阵,并构建分子树状图,结果表明,一串红白色与红色系列亲缘关系较近,其中,红色和粉红色亲缘关系最近;淡紫色和紫红色亲缘关系较近,但与白色和红色系列亲缘关系较远。
关键词:一串红;花色;亲缘关系
中图分类号: S681.403文献标志码: A文章编号:1002-1302(2015)02-0179-02
收稿日期:2014-04-01
基金项目:山西省青年科技研究基金(编号:2013021026-2);山西林业职业技术学院院级科研教改项目(编号:201314)。
作者简介:侯艳霞(1981―),女,山西交城人,博士,讲师,从事园艺植物生物技术研究。E-mail:yxhou2007@163.com。
通信作者:汤浩茹,博士,教授,从事果树生物技术和遗传育种研究。E-mail:htang@。一串红(Salvia splendens Ker-Gawl)为唇形科鼠尾草属多年生草本花卉[1],原产南美巴西[2],现世界各地广泛栽植。一串红是我国节日传统用花,除具有较高的观赏价值外,在医药、食品、化妆品等领域也有一定的经济价值和开发前景[3-4]。随着人们生活水平的提高,消费者对一串红的品质要求愈来愈高。作为观花植物,花色是决定一串红品质的重要因素之一。目前,一串红花色还比较单调,只有红色系、白色系和紫色系等花色[5],育种学家希望培育出花色更为丰富多彩的一串红品种。本试验利用RAPD和ISSR标记技术,从分子水平探讨5种不同花色一串红的亲缘关系,旨在为一串红花色育种提供理论依据。
1材料与方法
1.1材料
展望系列的一串红,5种花色分别为白色、红色、粉色、淡紫色和紫红色。RAPD引物,购自北京赛百胜基因有限公司;ISSR引物,购自上海申能博彩生物科技有限公司。
1.2方法
1.2.1总DNA的提取采用核DNA法提取基因组DNA[6]。
1.2.2PCR扩增和电泳从90条RAPD引物和70条ISSR引物中分别筛选出扩增条带清晰、重复性较好的15条引物用于PCR扩增(表1)。RAPD扩增反应体系(20 μL)为:10×buffer 2.0 μL,模板DNA 20 ng,Mg2+浓度 2.0 mmol/L,引物浓度0.6 μmol/L,dNTPs浓度0.2 mmol/L,Taq酶1.0 U。ISSR扩增反应体系(20 μL)为:10×buffer 2.0 μL,模板DNA 10 ng,Mg2+浓度2.0 mmol/L,引物浓度0.5 μmol/L,dNTPs浓度0.3 mmol/L,Taq酶 1.0 U。RAPD和ISSR扩增反应程序为:94 ℃预变性5 min;94 ℃变性1 min,RAPD 36 ℃或ISSR 52 ℃退火1 min,72 ℃延伸2 min,40个循环;72 ℃延伸 10 min。产物用1.5%琼脂糖凝胶电泳,溴化乙锭染色,紫外观察并照相分析。
1.2.3数据分析扩增结果以0、1统计,建立DNA指纹数据,相同迁移率位置有带赋值为1,无带赋值为0,录入Excel,得到原始数据表征矩阵。将矩阵用软件NTSYSPC 2.10分析聚类,计算Nei氏遗传距离。基于遗传距离,利用UPGMA法对供试材料进行聚类分析,构建树状图。
2结果与分析
2.1不同花色一串红PCR扩增结果
RAPD和ISSR选用的引物分别扩增出224条和215条DNA谱带,大小均在200~4 000 bp之间,其中多态性片断分别为166条和185条,占扩增总带数的74.11%和86.05%;每个引物扩增的带数分别在10~18条和8~19条之间,平均为14.93条和14.33条;有30条引物在同一试材上的扩增结果均不相同,同一引物对不同材料的扩增结果也不尽相同,表明一串红5种花色之间存在较明显的DNA序列差异。由图1可见,RAPD和ISSR 2种标记对供试材料的扩增效果都较好,均得到带型清晰、条带较亮且多态性较好的条带。
2.2不同花色一串红遗传关系
2.2.1遗传距离分析由表2可见,基于RAPD分析的遗传距离,变异范围为0.05~0.64,平均为0.40,其中,红色和淡紫色之间的遗传距离最大,为0.64,红色和粉色之间的遗传距离最小,为0.05;基于ISSR分析的遗传距离,变异范围为0.15~0.79,平均为0.52,其中,粉色和淡紫色之间的遗传距离最大,为0.79,红色和粉色之间的遗传距离最小,为0.15。虽然2种标记对遗传距离最大的2种花色标记结果不同,但总体结果相似,都是白色、红色和粉色之间遗传距离差异较小,亲缘关系较近
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