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附录1 常用基本词汇表 英 文 名 词 中 文 名 词 解 释 A（Adenine） 腺嘌呤 作为碱基的两种嘌呤中的一种。 active site 活化位点 蛋白质三维表面催化作用发生的区域。 alignment 比对 为了确定两个同源核酸或蛋白质序列的累计差异而进行的配对称为比对。 alignment of alignments 比对的比对 即比对的对象不是简单的序列，而是序列的比对。 alleles 等位基因 一个基因的不同版本。 alpha carbon α碳 在氨基酸中与侧链（R-基团）相连的中心碳原子。 alternative splicing 可变剪接 从一个单独的hnRNA生成两个或多个mRNA分子的过程。 amino terminus (N-terminal) 氨基端（N端） 在一个多肽中，具有自由氨基的分子端，对应于基因的5’-端。 anti-parallel 反向平行 表示相反的方向；在双链DNA中，这意味着如果一条链是5 到 3的，则其互补链方向是3 到5的。 backbone (of an amino acid) （氨基酸的）骨架 包含一个氨基，一个α碳和一个羧酸或羧基。 base pair 碱基对 （1）在双链DNA中嘌呤和嘧啶之间的相互作用（特别指A和T之间，G和C之间）；（2）双链DNA序列长度的基本单位。 beta turns β转角 在反向平行的β折叠片中，当β链反转方向的时候蛋白质内部形成的U型结构。 Bioinformatics 生物信息学 应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据。 Biocomputing 生物计算 本书中特指用计算机技术分析和处理生物分子数据。 Basic Local Alignment Search Tool ( Blast) 基本的局部比对搜索工具（Blast） 一种常用的序列数据库搜索工具。 blotting and hybridization 印迹和杂交 将分子（通常是核酸分子）从凝胶转移到膜上，接着用绑定有特定感兴趣的分子的标记探针进行洗脱的过程。 bootstrap test 自举检验 对置信程度进行量化的检验。 branch and bound method 分支约束法 一种空间搜索方法，通过约束条件减少搜索空间，提高搜索效率。 branches 分支 在系统发生树中，通过分支连接两个节点。 C (Cytosine) 胞嘧啶 作为碱基的两种嘧啶中的一种。 CAAT box CAAT盒 大多数真核启动子具有的一段短序列，其片段模式为C-A-A-T，通常出现在转录起始位点上游80个核苷酸的地方。许多因子可以与CAAT盒结合。 carboxy terminus 羧基端 在多肽链中，含有羧酸基团(—COOH)的分子端，对应于基因的3-端。 cDNA Complementary DNA cDNA 互补DNA 通过逆转录酶从RNA模板合成的DNA。 cDNA library cDNA文库 从mRNA序列中产生的所有DNA序列的集合。这种类型的文库只包含编码蛋白质的DNA（基因）。 central dogma 中心法则 从基因的核酸序列中提取信息并以此合成蛋白质的过程（DNA?RNA? protein）。 character 特征 在系统发生树中，具有有限状态数的特征。 charged amino acid 带电氨基酸 在一定的生物pH值下，带有正电或负电的氨基酸。 chromatin 染色质 在真核生物细胞核内部由大量DNA以及与此相关的组蛋白组成的近似均匀混合物。 chromosome 染色体 在原核生物，包含一个细胞基因组的DNA分子称为染色体。在真核生物中，与蛋白质复合在一起、包含大量遗传信息的线型DNA分子。 clone 克隆 无性繁殖，如生物体克隆、基因克隆等。 cloning 克隆 在类染色体载体中插入特定的DNA一段，使得它们可以在活细胞中得以保存并复制。 coding sequence 编码序列 DNA序列中为蛋白质编码的部分。 codon 密码子 基因编码部分的三核苷酸组合，对应于一个特定的氨基酸。 Complementary 互补的 （1）通过氢键连接的核苷酸对（G 和C; A 和 T; A 和 U）；（2）核苷酸链的反向平行对。 Computational Molecular Biology 计算分子生物学 主要研究分子生物学数据的分析方法，开发分析工具。 conformation 构象 蛋白质的空间构象。 consensus sequence 一致序列 在两个或多个同源序列的每一个位置上多数出现的核苷酸或氨基酸组成的序列。 conserved sequence 保守序列 在进化过程中基本保持不变