分子标记及遗传连锁图谱课件.ppt

Cultivar /accession number The 104th bp The 147th bp The 213th bp The 252th bp* The 283th bp* The 329th bp The 335th bp The 342th bp The 532th bp The 719th bp Jinchun No.4 A A A A A C T T G T Zaofeng No.1 A A A A A C T T G T Zhongnong No.8 A A A A A C T T G T Qiuci No.1 A A A A A Tc T T G Ci MT705 A Gnc A A A C Cc T G T MT700 A A Gnc A A C T Cc G T Zhongnong No.5 Gnc A A A A C T T G T Zhongnong No.203 A A A A A C T T Ac T AB032938 A A A Gnc Tc C T T G T The number of base pairs is based on DNA sequence in this study; i:intron region; c: coding region in exon; nc: non-coding region in exon. 3、寻找与多基因性状相关的基因 进行简单和复杂疾病的遗传连锁分析(linkage analysis)及关联分析(association analysis),用于疾病易感基因定位；而且其定位的精度将比微卫星标记精细得多，可直接用于指导易感基因克隆。 日本学者发现糖尿病基因的个人SNP差别 日本研究人员最近经过研究发现，与糖尿病有关的基因并不是千篇一律，它们之间存在着个人差别，即“单核苷酸多态性”（SNP）。 4、SNP在“药物基因学”(pharmacogenomics)研究中应用 不同个体的药物反应（主要指药效与毒性）差异与DNA多态性的关系。即通过DNA序列差异的分析，从基因水平上深入认识疾病及药物作用的个体差异的机理，指导和优化临床用药。并有可能在此基础上发展个体化医疗。 在“药物基因组学”(pharmacogenomics)研究中，可通过检测SNP的遗传多态性标记揭示人群中不同个体对不同药物的敏感性差异的根本原因。 SNPs affecting drug effects Polymorphisms in enzymes that metabolize drugs are responsible for unexpected toxicity after administration of a normal drug dose. SNPs in the coding regions of genes of the enzymes necessary for the biotransformation of endogenous and exogenous compounds can decrease or even prevent drug metabolism. Cytochrome P450 细胞色素Ｐ450 (CYP)同功酶是药物代谢酶并显示了基因多态性。人体内有六种不同的细胞色素Ｐ450 ：CYP1A2 , CYP2C9, CYP2C1 9, CYP2D6, CYP2E1和CYP3A4负责清理体内药物。 CYP2C9, CYP2C1 9, CYP2D6的多态性与个体间差异有很大关联性。如果有人缺失这种酶 ,常常被称为‘差的’或‘慢的’药物代谢体ＰＭ(poor metabolizer), 这种人有较大的高药物浓度中毒的可能性 ;如果有高活性或过量的这些酶 ,就被称为‘快速的’代谢体 ,这种人对药物治疗可能有抗性。 第三节、其他新型分子标记技术 一、序列标签位点（sequence tagged site,STS) 标记技术 1、STS标记的原理： STS是指基因组中长度为200-500bp，且核苷酸顺序已知的单拷贝序列，通过PCR可将其专一扩增出来。其基本原理是，依据两端序列，设计合适的引物，进行PCR扩增，电泳显示扩增产物多态性。 STS是以特定引物序列进行PCR特异扩增的一类分子标记的统称。这种特异PCR技术的最大优点是它产生的信息非常可靠，不象RAPD、AFLP和RFLP那样